From f4af080b046c90d1a02e209e8d25d62b022642fe Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: williamWan Date: Wed, 29 Oct 2025 21:46:54 +0800 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?=E5=8C=85=E5=90=AB=E8=8D=AF=E5=93=81=E6=A1=A3?= =?UTF-8?q?=E6=A1=88=E7=9A=84=E7=89=88=E6=9C=AC?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- .dockerignore | 92 +- .vscode/settings.json | 3 +- Dockerfile | 77 ++ Java版本问题解决指南.txt | 168 --- Java环境问题解决.txt | 102 -- PROJECT_STRUCTURE.md | 229 ---- README_PROJECT.md | 222 ---- Readme.md | 44 - START_GUIDE.md | 171 --- .../ipsen/medical/config/SecurityConfig.java | 7 + .../medical/controller/DrugController.java | 153 +++ .../medical/controller/InquiryController.java | 74 ++ .../ipsen/medical/dto/ClinicalTrialDTO.java | 50 + .../dto/ClinicalTrialsSearchResult.java | 29 + .../com/ipsen/medical/dto/DifyRequest.java | 41 + .../com/ipsen/medical/dto/DifyResponse.java | 58 + .../java/com/ipsen/medical/dto/DrugDTO.java | 28 + .../ipsen/medical/dto/DrugSafetyInfoDTO.java | 27 + .../medical/dto/KeywordExtractionResult.java | 31 + .../ipsen/medical/entity/ClinicalTrial.java | 106 ++ .../java/com/ipsen/medical/entity/Drug.java | 81 ++ .../ipsen/medical/entity/DrugSafetyInfo.java | 118 ++ .../repository/ClinicalTrialRepository.java | 39 + .../medical/repository/DrugRepository.java | 28 + .../repository/DrugSafetyInfoRepository.java | 21 + .../medical/service/AutoSearchService.java | 24 + .../service/ClinicalTrialsService.java | 52 + .../ipsen/medical/service/DifyService.java | 9 +- .../ipsen/medical/service/DrugService.java | 76 ++ .../service/impl/AutoSearchServiceImpl.java | 209 ++++ .../impl/ClinicalTrialsServiceImpl.java | 442 +++++++ .../medical/service/impl/DifyServiceImpl.java | 190 ++- .../medical/service/impl/DrugServiceImpl.java | 262 ++++ backend/src/main/resources/application.yml | 2 +- database/add_clinical_trials_table.sql | 57 + database/drug_sample_data.sql | 149 +++ .../fix_clinical_trials_unique_constraint.sql | 17 + database/init_drug_module.sql | 215 ++++ database/schema.sql | 89 ++ docker-compose.yml | 116 +- frontend/src/api/drug.js | 139 +++ frontend/src/api/inquiry.js | 61 + frontend/src/router/index.js | 21 + frontend/src/views/drug/DrugDetail.vue | 224 ++++ frontend/src/views/drug/DrugList.vue | 190 +++ .../views/drug/components/SafetyInfoList.vue | 266 ++++ frontend/src/views/inquiry/InquiryCreate.vue | 4 +- frontend/src/views/inquiry/InquiryDetail.vue | 327 ++++- presentation.html | 1073 +++++++++++++++++ screenshots/README.md | 152 +++ start-dev.bat | 97 -- start.bat | 74 -- start.sh | 70 -- 启动前后端.bat | 50 - 数据库初始化指南.txt | 101 -- 方案二执行完成报告.md | 126 -- 56 files changed, 5286 insertions(+), 1597 deletions(-) create mode 100644 Dockerfile delete mode 100644 Java版本问题解决指南.txt delete mode 100644 Java环境问题解决.txt delete mode 100644 PROJECT_STRUCTURE.md delete mode 100644 README_PROJECT.md delete mode 100644 Readme.md delete mode 100644 START_GUIDE.md create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/DrugController.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialDTO.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialsSearchResult.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyRequest.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyResponse.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugDTO.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugSafetyInfoDTO.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/KeywordExtractionResult.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/ClinicalTrial.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/Drug.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/DrugSafetyInfo.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/ClinicalTrialRepository.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugRepository.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugSafetyInfoRepository.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/AutoSearchService.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/ClinicalTrialsService.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DrugService.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/AutoSearchServiceImpl.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/ClinicalTrialsServiceImpl.java create mode 100644 backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DrugServiceImpl.java create mode 100644 database/add_clinical_trials_table.sql create mode 100644 database/drug_sample_data.sql create mode 100644 database/fix_clinical_trials_unique_constraint.sql create mode 100644 database/init_drug_module.sql create mode 100644 frontend/src/api/drug.js create mode 100644 frontend/src/views/drug/DrugDetail.vue create mode 100644 frontend/src/views/drug/DrugList.vue create mode 100644 frontend/src/views/drug/components/SafetyInfoList.vue create mode 100644 presentation.html create mode 100644 screenshots/README.md delete mode 100644 start-dev.bat delete mode 100644 start.bat delete mode 100644 start.sh delete mode 100644 启动前后端.bat delete mode 100644 数据库初始化指南.txt delete mode 100644 方案二执行完成报告.md diff --git a/.dockerignore b/.dockerignore index ef8953e..8893889 100644 --- a/.dockerignore +++ b/.dockerignore @@ -1,34 +1,62 @@ -# Git -.git -.gitignore +# Include any files or directories that you don't want to be copied to your +# container here (e.g., local build artifacts, temporary files, etc.). +# +# For more help, visit the .dockerignore file reference guide at +# https://docs.docker.com/go/build-context-dockerignore/ -# Documentation -*.md +**/.DS_Store +**/.classpath +**/.dockerignore +**/.env +**/.factorypath +**/.git +**/.gitignore +**/.idea +**/.project +**/.sts4-cache +**/.settings +**/.toolstarget +**/.vs +**/.vscode +**/.next +**/.cache +**/*.dbmdl +**/*.jfm +**/charts +**/docker-compose* +**/compose.y*ml +**/Dockerfile* +**/secrets.dev.yaml +**/values.dev.yaml +**/vendor LICENSE - -# Docker -docker-compose.yml -Dockerfile -.dockerignore - -# Logs -logs -*.log - -# IDE -.idea -.vscode -*.iml - -# Temporary files -*.tmp -*.bak -*.swp - -# OS files -.DS_Store -Thumbs.db - - - - +README.md +**/*.class +**/*.iml +**/*.ipr +**/*.iws +**/*.log +**/.apt_generated +**/.gradle +**/.gradletasknamecache +**/.nb-gradle +**/.springBeans +**/build +**/dist +**/gradle-app.setting +**/nbbuild +**/nbdist +**/nbproject/private +**/target +*.ctxt +.mtj.tmp +.mvn/timing.properties +buildNumber.properties +dependency-reduced-pom.xml +hs_err_pid* +pom.xml.next +pom.xml.releaseBackup +pom.xml.tag +pom.xml.versionsBackup +release.properties +replay_pid* \ No newline at end of file diff --git a/.vscode/settings.json b/.vscode/settings.json index c5f3f6b..b84f89c 100644 --- a/.vscode/settings.json +++ b/.vscode/settings.json @@ -1,3 +1,4 @@ { - "java.configuration.updateBuildConfiguration": "interactive" + "java.configuration.updateBuildConfiguration": "interactive", + "java.compile.nullAnalysis.mode": "automatic" } \ No newline at end of file diff --git a/Dockerfile b/Dockerfile new file mode 100644 index 0000000..a35946d --- /dev/null +++ b/Dockerfile @@ -0,0 +1,77 @@ +# syntax=docker/dockerfile:1 + +# Comments are provided throughout this file to help you get started. +# If you need more help, visit the Dockerfile reference guide at +# https://docs.docker.com/go/dockerfile-reference/ + +# Want to help us make this template better? Share your feedback here: https://forms.gle/ybq9Krt8jtBL3iCk7 + +################################################################################ + +# Create a stage for resolving and downloading dependencies. +FROM eclipse-temurin:8-jdk-jammy as deps + +WORKDIR /build + +# Copy the mvnw wrapper with executable permissions. +COPY --chmod=0755 mvnw mvnw +COPY .mvn/ .mvn/ + +# Download dependencies as a separate step to take advantage of Docker's caching. +# Leverage a cache mount to /root/.m2 so that subsequent builds don't have to +# re-download packages. +RUN --mount=type=bind,source=pom.xml,target=pom.xml \ + --mount=type=cache,target=/root/.m2 ./mvnw dependency:go-offline -DskipTests + +################################################################################ + +# Create a stage for building the application based on the stage with downloaded dependencies. +# This Dockerfile is optimized for Java applications that output an uber jar, which includes +# all the dependencies needed to run your app inside a JVM. If your app doesn't output an uber +# jar and instead relies on an application server like Apache Tomcat, you'll need to update this +# stage with the correct filename of your package and update the base image of the "final" stage +# use the relevant app server, e.g., using tomcat (https://hub.docker.com/_/tomcat/) as a base image. +FROM deps as package + +WORKDIR /build + +COPY ./ src/ +RUN --mount=type=bind,source=pom.xml,target=pom.xml \ + --mount=type=cache,target=/root/.m2 \ + ./mvnw package -DskipTests && \ + mv target/$(./mvnw help:evaluate -Dexpression=project.artifactId -q -DforceStdout)-$(./mvnw help:evaluate -Dexpression=project.version -q -DforceStdout).jar target/app.jar + + +################################################################################ + +# Create a new stage for running the application that contains the minimal +# runtime dependencies for the application. This often uses a different base +# image from the install or build stage where the necessary files are copied +# from the install stage. +# +# The example below uses eclipse-temurin's JRE image as the foundation for running the app. +# By specifying the "8-jre-jammy" tag, it will also use whatever happens to be the +# most recent version of that tag when you build your Dockerfile. +# If reproducibility is important, consider using a specific digest SHA, like +# eclipse-temurin@sha256:99cede493dfd88720b610eb8077c8688d3cca50003d76d1d539b0efc8cca72b4. +FROM eclipse-temurin:8-jre-jammy AS final + +# Create a non-privileged user that the app will run under. +# See https://docs.docker.com/go/dockerfile-user-best-practices/ +ARG UID=10001 +RUN adduser \ + --disabled-password \ + --gecos "" \ + --home "/nonexistent" \ + --shell "/sbin/nologin" \ + --no-create-home \ + --uid "${UID}" \ + appuser +USER appuser + +# Copy the executable from the "package" stage. +COPY --from=package build/target/app.jar app.jar + +EXPOSE 8080 + +ENTRYPOINT [ "java", "-jar", "app.jar" ] diff --git a/Java版本问题解决指南.txt b/Java版本问题解决指南.txt deleted file mode 100644 index c3d4c40..0000000 --- a/Java版本问题解决指南.txt +++ /dev/null @@ -1,168 +0,0 @@ -==================================== -Java版本不兼容问题 - 解决指南 -==================================== - -问题症状： ------------ -启动后端时出现错误： -"class file version 61.0, this version of the Java Runtime only recognizes class file versions up to 52.0" - -原因分析： ------------ -- Spring Boot 3.2.0 需要 Java 17+ -- 您当前使用的是 Java 8 -- 版本不匹配导致无法运行 - -==================================== -解决方案一：升级Java到17（推荐） -==================================== - -为什么推荐？ ------------ -✓ 使用最新技术栈 -✓ 更好的性能 -✓ 更多新特性 -✓ 长期支持版本 - -步骤： ------- - -1. 下载 Java 17 - 推荐下载地址： - - Oracle JDK 17: https://www.oracle.com/java/technologies/downloads/#java17 - - Eclipse Temurin 17: https://adoptium.net/temurin/releases/?version=17 - - 选择 Windows x64 Installer (.msi) - -2. 安装 Java 17 - - 双击下载的安装程序 - - 按默认选项安装（推荐路径：C:\Program Files\Java\jdk-17） - - 记住安装路径 - -3. 配置环境变量 - - 方法A - 使用图形界面： - a) 右键"此电脑" -> "属性" -> "高级系统设置" - b) 点击"环境变量" - c) 在"系统变量"中： - - 如果有JAVA_HOME，修改它： - 变量值改为：C:\Program Files\Java\jdk-17 - - 如果没有，新建JAVA_HOME： - 变量名：JAVA_HOME - 变量值：C:\Program Files\Java\jdk-17 - d) 编辑Path变量： - - 找到旧的Java路径（如果有），删除或移到底部 - - 在最前面添加：%JAVA_HOME%\bin - e) 点击"确定"保存 - - 方法B - 使用命令行（管理员权限）： - setx JAVA_HOME "C:\Program Files\Java\jdk-17" /M - -4. 验证安装 - - 打开新的命令行窗口（必须是新窗口！），执行： - - java -version - - 应该显示： - openjdk version "17.x.x" - 或 - java version "17.x.x" - -5. 重新启动项目 - - cd d:\SoftwarePrj\文献流程\backend - mvn clean spring-boot:run - -==================================== -解决方案二：降级到Spring Boot 2.7 -==================================== - -为什么选择？ ------------ -✓ 可以继续使用 Java 8 -✓ 无需升级Java -✗ 无法使用Spring Boot 3的新特性 - -步骤： ------- - -1. 备份原配置文件 - copy backend\pom.xml backend\pom-backup.xml - -2. 使用Java 8兼容的配置 - copy backend\pom-java8.xml backend\pom.xml - -3. 清理并重新编译 - cd backend - mvn clean install - -4. 启动服务 - mvn spring-boot:run - -==================================== -验证Java版本 -==================================== - -检查当前Java版本： ------------------- -java -version -javac -version - -检查Maven使用的Java版本： -------------------------- -mvn -version - -如果Maven使用的不是Java 17： ----------------------------- -编辑 Maven 配置文件： -%MAVEN_HOME%\bin\mvn.cmd - -或在项目根目录创建 .mvn/jvm.config 文件： --Djava.home=C:\Program Files\Java\jdk-17 - -==================================== -常见问题 -==================================== - -Q1: 安装了Java 17但java -version仍显示Java 8 -A1: 环境变量配置不正确或命令行窗口未重新打开 - - 关闭所有命令行窗口 - - 重新打开新窗口 - - 再次检查 java -version - -Q2: 有多个Java版本，如何切换？ -A2: 修改JAVA_HOME环境变量指向目标版本 - 或使用工具如 jEnv (Linux/Mac) 或手动切换 - -Q3: Maven仍然使用旧版本Java -A3: 检查 MAVEN_OPTS 环境变量 - 或在项目中创建 .mvn/jvm.config - -Q4: 降级到Spring Boot 2.7后出现新错误 -A4: 某些代码可能使用了Spring Boot 3的API - 需要根据具体错误调整代码 - 主要差异： - - javax.* -> jakarta.* (在Spring Boot 3中) - - 某些配置属性名称变化 - -==================================== -推荐方案 -==================================== - -对于新项目，强烈建议： -✓ 升级到 Java 17 -✓ 使用 Spring Boot 3.x -✓ 享受最新特性和性能改进 - -Java 17 是长期支持版本(LTS)，值得升级！ - -==================================== -需要帮助？ -==================================== - -1. 如选择方案一，下载安装Java 17后重新运行 start-dev.bat -2. 如选择方案二，按照步骤执行后重新运行 -3. 查看完整文档：DEPLOYMENT.md - - diff --git a/Java环境问题解决.txt b/Java环境问题解决.txt deleted file mode 100644 index 6e33d18..0000000 --- a/Java环境问题解决.txt +++ /dev/null @@ -1,102 +0,0 @@ -==================================== -Java环境问题诊断和解决 -==================================== - -问题分析： ------------ -您的系统中有Java版本不一致的问题： - -✓ java -version: 1.8.0_471 (JRE) -✓ javac -version: 1.8.0_161 (JDK) -✓ Maven使用: 1.8.0_471 (JRE) ← 问题所在 - -Maven需要JDK才能编译，但当前使用的是JRE。 - -==================================== -解决方案 -==================================== - -方案一：配置Maven使用正确的JDK（推荐） ------------------------------------- - -1. 找到JDK安装路径 - 根据javac版本，JDK可能在： - C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161 - -2. 设置JAVA_HOME环境变量 - - 方法A - 图形界面： - a) 右键"此电脑" -> "属性" -> "高级系统设置" - b) 点击"环境变量" - c) 在"系统变量"中： - - 修改JAVA_HOME为：C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161 - - 编辑Path变量，确保%JAVA_HOME%\bin在最前面 - - 方法B - 命令行（管理员权限）： - setx JAVA_HOME "C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161" /M - -3. 验证配置 - 打开新的命令行窗口： - java -version - javac -version - mvn -version - - 三个命令应该显示相同的Java版本 - -方案二：使用Maven的JVM配置 -------------------------- - -在项目根目录创建 .mvn/jvm.config 文件： - -1. 创建目录： - mkdir .mvn - -2. 创建文件 .mvn/jvm.config，内容： - -Djava.home=C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161 - -方案三：临时设置（当前会话有效） --------------------------------- - -在命令行中执行： -set JAVA_HOME=C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161 -set PATH=%JAVA_HOME%\bin;%PATH% - -然后重新运行Maven命令。 - -==================================== -推荐操作步骤 -==================================== - -1. 首先尝试方案一（永久解决） -2. 如果方案一不行，使用方案三（临时解决） -3. 重新运行编译命令 - -==================================== -验证步骤 -==================================== - -配置完成后，执行以下命令验证： - -1. java -version - 应该显示：java version "1.8.0_161" - -2. javac -version - 应该显示：javac 1.8.0_161 - -3. mvn -version - 应该显示：Java version: 1.8.0_161 - -4. 重新编译： - mvn clean compile - -==================================== -如果仍有问题 -==================================== - -1. 检查JDK是否完整安装 -2. 确认JAVA_HOME路径正确 -3. 重启命令行窗口 -4. 考虑重新安装JDK - -==================================== - diff --git a/PROJECT_STRUCTURE.md b/PROJECT_STRUCTURE.md deleted file mode 100644 index be594b1..0000000 --- a/PROJECT_STRUCTURE.md +++ /dev/null @@ -1,229 +0,0 @@ -# 医学信息支持系统 - 项目结构说明 - -## 项目概述 - -本项目是为益普生(Ipsen)开发的医学信息支持系统，旨在帮助医学信息团队快速处理客户（主要是医生）的信息支持需求。 - -## 技术栈 - -### 后端 -- **Java 17** -- **Spring Boot 3.2.0** -- **Spring Data JPA** -- **Spring Security** -- **MySQL 8.0** -- **Maven** - -### 前端 -- **Vue 3** -- **Vite** -- **Element Plus** -- **Pinia** (状态管理) -- **Vue Router** -- **Axios** - -### 部署 -- **Docker** -- **Docker Compose** -- **Nginx** - -## 项目结构 - -``` -文献流程/ -├── backend/ # 后端Spring Boot项目 -│ ├── src/ -│ │ ├── main/ -│ │ │ ├── java/com/ipsen/medical/ -│ │ │ │ ├── MedicalInfoApplication.java # 主应用类 -│ │ │ │ ├── controller/ # 控制器层 -│ │ │ │ │ ├── InquiryController.java -│ │ │ │ │ ├── KnowledgeBaseController.java -│ │ │ │ │ └── LiteratureController.java -│ │ │ │ ├── service/ # 服务层接口 -│ │ │ │ │ ├── InquiryService.java -│ │ │ │ │ ├── KnowledgeBaseService.java -│ │ │ │ │ ├── LiteratureService.java -│ │ │ │ │ ├── DifyService.java -│ │ │ │ │ └── ExcelParserService.java -│ │ │ │ ├── service/impl/ # 服务层实现 -│ │ │ │ │ ├── InquiryServiceImpl.java -│ │ │ │ │ ├── KnowledgeBaseServiceImpl.java -│ │ │ │ │ ├── LiteratureServiceImpl.java -│ │ │ │ │ ├── DifyServiceImpl.java -│ │ │ │ │ └── ExcelParserServiceImpl.java -│ │ │ │ ├── entity/ # 实体类 -│ │ │ │ │ ├── InquiryRequest.java -│ │ │ │ │ ├── KnowledgeBase.java -│ │ │ │ │ ├── Literature.java -│ │ │ │ │ ├── User.java -│ │ │ │ │ └── AuditLog.java -│ │ │ │ ├── repository/ # 数据访问层 -│ │ │ │ │ ├── InquiryRequestRepository.java -│ │ │ │ │ ├── KnowledgeBaseRepository.java -│ │ │ │ │ ├── LiteratureRepository.java -│ │ │ │ │ ├── UserRepository.java -│ │ │ │ │ └── AuditLogRepository.java -│ │ │ │ └── dto/ # 数据传输对象 -│ │ │ │ ├── ApiResponse.java -│ │ │ │ ├── InquiryRequestDTO.java -│ │ │ │ ├── KnowledgeBaseDTO.java -│ │ │ │ └── LiteratureDTO.java -│ │ │ └── resources/ -│ │ │ └── application.yml # 应用配置 -│ │ └── test/ # 测试代码 -│ ├── pom.xml # Maven配置 -│ ├── Dockerfile # Docker构建文件 -│ └── .gitignore -│ -├── frontend/ # 前端Vue3项目 -│ ├── src/ -│ │ ├── api/ # API接口 -│ │ │ ├── inquiry.js -│ │ │ ├── knowledge.js -│ │ │ └── literature.js -│ │ ├── assets/ # 静态资源 -│ │ ├── components/ # 通用组件 -│ │ ├── layout/ # 布局组件 -│ │ │ └── index.vue -│ │ ├── router/ # 路由配置 -│ │ │ └── index.js -│ │ ├── store/ # 状态管理 -│ │ ├── utils/ # 工具函数 -│ │ │ └── request.js -│ │ ├── views/ # 页面组件 -│ │ │ ├── Dashboard.vue # 工作台 -│ │ │ ├── Login.vue # 登录页 -│ │ │ ├── inquiry/ # 查询管理 -│ │ │ │ ├── InquiryList.vue -│ │ │ │ ├── InquiryCreate.vue -│ │ │ │ └── InquiryDetail.vue -│ │ │ ├── knowledge/ # 知识库管理 -│ │ │ │ └── KnowledgeList.vue -│ │ │ └── system/ # 系统设置 -│ │ │ ├── SystemConfig.vue -│ │ │ └── UserManagement.vue -│ │ ├── App.vue # 根组件 -│ │ └── main.js # 入口文件 -│ ├── index.html -│ ├── package.json # npm配置 -│ ├── vite.config.js # Vite配置 -│ ├── nginx.conf # Nginx配置 -│ ├── Dockerfile # Docker构建文件 -│ └── .gitignore -│ -├── database/ # 数据库脚本 -│ ├── schema.sql # 数据库结构 -│ └── sample_data.sql # 示例数据 -│ -├── docker-compose.yml # Docker Compose配置 -├── .env.example # 环境变量示例 -├── .dockerignore # Docker忽略文件 -├── Readme.md # 项目说明（需求文档） -└── PROJECT_STRUCTURE.md # 项目结构说明（本文件） -``` - -## 核心功能模块 - -### 1. 查询请求管理 (Inquiry Management) -- 上传标准化表格或手动创建查询请求 -- 自动提取关键词（药物名称、疾病、问题） -- 执行多层次信息检索 -- 生成回复内容 -- 审核流程管理 -- 文献下载 - -### 2. 知识库管理 (Knowledge Base Management) -- 支持三种类型知识库： - - **自有数据 (INTERNAL)**: 企业研究、历史回复、内部文献 - - **公开数据 (PUBLIC)**: PubMed、EMBASE、知网、ClinicalTrials.gov - - **扩展数据 (EXTENDED)**: 疾病药物关联数据 -- 优先级配置 -- 动态启用/禁用 - -### 3. 文献管理 (Literature Management) -- 文献检索结果展示 -- 文献选择 -- 批量下载 -- 多数据库账号配置 - -### 4. 系统配置 (System Configuration) -- Dify AI引擎配置 -- 大模型API配置 -- 文献下载账号配置 -- 用户管理 - -## 数据库设计 - -### 主要表结构 - -1. **users** - 用户表 - - 管理员 (ADMIN) - - 医学信息专员 (MEDICAL_SPECIALIST) - - 审核人员 (REVIEWER) - -2. **inquiry_requests** - 查询请求表 - - 请求状态流转：PENDING → KEYWORD_EXTRACTED → SEARCHING → SEARCH_COMPLETED → UNDER_REVIEW → DOWNLOADING → COMPLETED - -3. **knowledge_bases** - 知识库表 - - 类型、优先级、配置管理 - -4. **literatures** - 文献表 - - 文献信息、下载状态 - -5. **audit_logs** - 审核日志表 - - 操作追踪、审核记录 - -## API接口 - -### 查询管理 API -- `POST /api/inquiries/upload` - 上传查询表格 -- `POST /api/inquiries` - 创建查询请求 -- `GET /api/inquiries` - 获取查询列表 -- `GET /api/inquiries/{id}` - 获取查询详情 -- `POST /api/inquiries/{id}/extract-keywords` - 提取关键词 -- `POST /api/inquiries/{id}/search` - 执行检索 -- `POST /api/inquiries/{id}/generate-response` - 生成回复 -- `POST /api/inquiries/{id}/review` - 审核回复 -- `POST /api/inquiries/{id}/complete` - 完成处理 - -### 知识库管理 API -- `GET /api/knowledge-bases` - 获取知识库列表 -- `POST /api/knowledge-bases` - 创建知识库 -- `PUT /api/knowledge-bases/{id}` - 更新知识库 -- `DELETE /api/knowledge-bases/{id}` - 删除知识库 -- `PATCH /api/knowledge-bases/{id}/toggle` - 启用/禁用 - -### 文献管理 API -- `GET /api/literatures/inquiry/{inquiryId}` - 获取文献列表 -- `POST /api/literatures/{id}/select` - 选择文献 -- `POST /api/literatures/{id}/download` - 下载文献 -- `POST /api/literatures/inquiry/{inquiryId}/download-selected` - 批量下载 - -## 工作流程 - -1. **接收请求**: 医学信息专员上传标准化表格或手动填写查询内容 -2. **关键词提取**: 系统调用Dify API提取关键词 -3. **信息检索**: 按优先级在各知识库中检索相关信息 -4. **生成回复**: 系统整理检索结果，生成回复草稿 -5. **人工审核**: 审核人员审核回复内容 -6. **下载文献**: 系统下载选中的文献 -7. **完成处理**: 将回复和文献发送给客户 - -## 扩展点 - -系统设计了多个扩展点，便于后续功能增强： - -1. **AI引擎**: 使用Dify作为AI引擎，支持切换不同的大模型 -2. **知识库**: 支持动态添加新的知识库类型 -3. **文献下载**: 支持添加新的文献数据库 -4. **审核流程**: 可扩展多级审核流程 -5. **权限管理**: 基于角色的权限控制 - -## 开发说明 - -详细的部署和开发说明请参考 `DEPLOYMENT.md` 文件。 - - - - diff --git a/README_PROJECT.md b/README_PROJECT.md deleted file mode 100644 index b21e0dd..0000000 --- a/README_PROJECT.md +++ /dev/null @@ -1,222 +0,0 @@ -# 医学信息支持系统 - -
- -![Version](https://img.shields.io/badge/version-1.0.0-blue.svg) -![Java](https://img.shields.io/badge/Java-17-orange.svg) -![Spring Boot](https://img.shields.io/badge/Spring%20Boot-3.2.0-green.svg) -![Vue](https://img.shields.io/badge/Vue-3.4.0-brightgreen.svg) -![License](https://img.shields.io/badge/license-Proprietary-red.svg) - -一个为制药企业设计的智能医学信息支持系统，帮助医学信息团队高效处理客户的信息需求。 - -
- -## 📋 项目简介 - -本系统为益普生(Ipsen)开发，用于处理来自医生等客户的医学信息查询请求。系统集成AI技术，能够自动提取关键词、检索相关文献、生成回复内容，并支持多级审核流程。 - -### 核心特性 - -- 🤖 **AI驱动**: 集成Dify AI引擎，自动提取关键词和生成回复 -- 📚 **多层次检索**: 支持企业自有数据、公开数据库、扩展数据的分层检索 -- 📄 **文献管理**: 自动检索和下载PubMed、EMBASE、知网等数据库文献 -- ✅ **审核流程**: 完整的工作流程管理和审核机制 -- 🔧 **灵活配置**: 知识库、数据源、优先级可动态配置 -- 🐳 **容器化部署**: 支持Docker一键部署 - -## 🏗️ 技术架构 - -### 后端技术栈 -- Java 17 -- Spring Boot 3.2.0 -- Spring Data JPA -- Spring Security -- MySQL 8.0 -- Maven - -### 前端技术栈 -- Vue 3 -- Vite -- Element Plus -- Pinia -- Vue Router -- Axios - -### AI & 第三方服务 -- Dify AI Platform -- OpenAI / 其他大模型 -- PubMed、EMBASE、知网等文献数据库 - -## 🚀 快速开始 - -### 使用Docker部署（推荐） - -1. **克隆项目** -```bash -git clone -cd 文献流程 -``` - -2. **配置环境变量** -```bash -cp .env.example .env -# 编辑.env文件，配置数据库密码、API密钥等 -``` - -3. **启动服务** -```bash -docker-compose up -d -``` - -4. **访问系统** -- 前端: http://localhost -- 后端API: http://localhost:8080/api -- 默认账号: `admin` / `admin123` - -### 本地开发 - -详细的本地开发环境搭建请参考 [DEPLOYMENT.md](./DEPLOYMENT.md) - -## 📖 项目文档 - -- [项目结构说明](./PROJECT_STRUCTURE.md) - 详细的项目结构和模块说明 -- [部署指南](./DEPLOYMENT.md) - 完整的部署和配置指南 -- [需求文档](./Readme.md) - 原始业务需求和功能说明 - -## 🔑 核心功能 - -### 1. 查询请求管理 -- 支持上传标准化Excel表格或手动创建查询 -- 自动提取查询关键词（药物、疾病、问题） -- 多数据源智能检索 -- AI辅助生成回复内容 - -### 2. 知识库管理 -- **自有数据**: 企业研究、历史回复、内部文献 -- **公开数据**: PubMed、EMBASE、知网、ClinicalTrials.gov -- **扩展数据**: 疾病药物关联、相关扩展信息 -- 支持优先级配置和动态启用/禁用 - -### 3. 文献管理 -- 自动检索多个文献数据库 -- 支持文献筛选和批量下载 -- 配置多个数据库账号 - -### 4. 工作流程 -``` -接收请求 → 提取关键词 → 信息检索 → 生成回复 → 审核 → 下载文献 → 完成 -``` - -### 5. 系统管理 -- 用户管理（管理员、医学信息专员、审核人员） -- Dify API配置 -- 大模型配置 -- 文献数据库账号配置 - -## 📊 系统架构 - -``` -┌─────────────┐ -│ 客户端 │ (Vue3 + Element Plus) -└──────┬──────┘ - │ HTTP/HTTPS - ▼ -┌─────────────┐ -│ Nginx │ (反向代理) -└──────┬──────┘ - │ - ├─────────────► 静态资源 - │ - ▼ -┌─────────────┐ -│ Spring Boot │ (REST API) -└──────┬──────┘ - │ - ├──────► MySQL (数据存储) - │ - ├──────► Dify API (AI服务) - │ - └──────► 文献数据库 (PubMed/EMBASE/CNKI) -``` - -## 🗂️ 数据库设计 - -主要数据表： -- `users` - 用户管理 -- `inquiry_requests` - 查询请求 -- `knowledge_bases` - 知识库配置 -- `literatures` - 文献信息 -- `audit_logs` - 审核日志 - -详细的数据库结构请参考 [database/schema.sql](./database/schema.sql) - -## 🔐 安全性 - -- JWT身份认证 -- 基于角色的访问控制(RBAC) -- 密码加密存储 -- API请求限流 -- SQL注入防护 - -## 🌐 API接口 - -### 查询管理 -``` -POST /api/inquiries/upload # 上传查询表格 -POST /api/inquiries # 创建查询 -GET /api/inquiries # 查询列表 -GET /api/inquiries/{id} # 查询详情 -POST /api/inquiries/{id}/extract-keywords # 提取关键词 -POST /api/inquiries/{id}/search # 执行检索 -POST /api/inquiries/{id}/generate-response # 生成回复 -POST /api/inquiries/{id}/review # 审核 -``` - -### 知识库管理 -``` -GET /api/knowledge-bases # 列表 -POST /api/knowledge-bases # 创建 -PUT /api/knowledge-bases/{id} # 更新 -DELETE /api/knowledge-bases/{id} # 删除 -``` - -### 文献管理 -``` -GET /api/literatures/inquiry/{id} # 获取文献 -POST /api/literatures/{id}/download # 下载文献 -POST /api/literatures/inquiry/{id}/download-selected # 批量下载 -``` - -## 📝 开发计划 - -- [ ] 实现完整的用户认证和授权 -- [ ] 集成实际的Dify API -- [ ] 实现文献自动下载功能 -- [ ] 添加数据统计和报表功能 -- [ ] 实现邮件通知功能 -- [ ] 添加API文档（Swagger） -- [ ] 性能优化和缓存策略 -- [ ] 单元测试和集成测试 - -## 🤝 贡献指南 - -本项目为企业内部项目，暂不接受外部贡献。 - -## 📄 许可证 - -本项目为专有软件，版权归益普生(Ipsen)所有。 - -## 👥 联系方式 - -如有问题或建议，请联系项目团队。 - ---- - -
-Made with ❤️ for Ipsen Medical Information Team -
- - - - diff --git a/Readme.md b/Readme.md deleted file mode 100644 index d714d6a..0000000 --- a/Readme.md +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -Readme - -网站目的及功能 - -以益普生的达菲林为具体数据，我需要构建一个网站，解决企业在受到客户（主要是医生）的信息支持需求时，能够利用该网站快速处理信息，给到客户支持。 - -业务流程 -1.客户通过邮件，向益普生提出需求，比如，请提供达菲林最新的临床试验数据。 -2.医学信息团队会记录这些需求，并指派给专门人员进行信息的查询，并进行回复。 -3.需要的网站功能从此步开始，医学信息专员将需要查询的内容，以标准化的表格，上传到我们的网站。 -4.网站收到表格后，会进行处理，并给出回复。具体的处理步骤如下： -4.1 提取需要检索的关键词，如药物名称、疾病、问题。 -4.2 根据关键词，进行信息检索。检索的顺序，首先是企业自有数据、第二部 公开数据； 第三步关联的扩展数据数据。 -4.3 根据检索到的信息，进行整理，形成回复的内容。 -4.4 将回复的内容，发送给医学信息人员，由其进行审核。 -4.5 确认回复的思路后，指出需要下载的文献，系统根据客户需求，将文献下载到本地。下载文献所用账号，之前已配置于系统中。 -4.6 将下载的文献，发送给医学信息人员，由其进行审核。 -4.7 确认无误后，将回复的内容，发送给客户。 - -为了支持信息的查询，系统的后台需要配置以下信息： -1. 检索的顺序，首先是企业自有数据、第二部 公开数据； 第三步关联的扩展数据数据。 -2. 检索的文献，需要配置文献的下载账号。 -3. 需要配置文献的下载路径。 -4. 知识库的配置，包括知识库的类型、知识库的地址等。 - 4.1 自由数据：以企业开展的研究、历史的回复、文献等为主； - 4.2 公开数据 ：以第三方数据库为主，包括监管机构网站、知网、Pubmed、EMBASE、ClinicalTrials.gov等已有数据，此类数据已由人工进行过整理，并配置于系统中； - 4.3 扩展数据：以关联的扩展数据为主，包括疾病、药物、疾病药物关联等数据，此类数据已由人工进行过整理，并配置于系统中； -5. 系统应有知识库的管理页面，以方便管理知识库中的数据。 - - - -技术架构要求： -1. 开发语言 Java -2. 系统应采用前后端分离的架构，前端采用Vue3，后端采用Spring Boot。 -3. 数据库采用MySQL。 -4. 涉及到AI相关功能，需要调用大模型的API，因此需要配置大模型的API Key。 -5. 将使用Dify作为AI的引擎，因此需要配置Dify的API Key。 - - - - - - - diff --git a/START_GUIDE.md b/START_GUIDE.md deleted file mode 100644 index 4ad593d..0000000 --- a/START_GUIDE.md +++ /dev/null @@ -1,171 +0,0 @@ -# 快速启动指南 - -## 方式一：使用Docker（推荐 - 最简单） - -### 1. 确保Docker Desktop已安装并运行 - -### 2. 创建配置文件 -在项目根目录创建 `.env` 文件（如果不存在）： -```bash -copy .env.example .env -``` - -编辑 `.env` 文件，配置必要的信息（数据库密码、API密钥等） - -### 3. 启动所有服务 -```bash -# Windows -start.bat - -# 或者手动执行 -docker-compose up -d -``` - -### 4. 访问系统 -- 前端: http://localhost -- 后端API: http://localhost:8080/api -- 默认账号: admin / admin123 - ---- - -## 方式二：本地开发环境 - -### 前置要求 -- ✅ JDK 17+ -- ✅ Maven 3.8+ -- ✅ Node.js 18+ -- ✅ MySQL 8.0+ - -### 步骤1: 启动MySQL数据库 - -```bash -# 启动MySQL服务 -# Windows: 在服务中启动MySQL -# Linux: sudo systemctl start mysql -``` - -### 步骤2: 创建数据库 - -```sql --- 连接MySQL -mysql -u root -p - --- 执行数据库脚本 -source database/schema.sql -source database/sample_data.sql -``` - -### 步骤3: 启动后端服务 - -**打开第一个命令行窗口：** - -```bash -# 进入后端目录 -cd backend - -# 启动Spring Boot（会自动编译） -mvn spring-boot:run -``` - -或者如果已经编译过： -```bash -cd backend -java -jar target/medical-info-system-1.0.0.jar -``` - -后端服务将在 **http://localhost:8080** 启动 - -### 步骤4: 启动前端服务 - -**打开第二个命令行窗口：** - -```bash -# 进入前端目录 -cd frontend - -# 安装依赖（首次运行） -npm install - -# 启动开发服务器 -npm run dev -``` - -前端服务将在 **http://localhost:3000** 启动 - ---- - -## 验证服务状态 - -### 检查后端 -访问: http://localhost:8080/api/inquiries - -应该返回JSON数据（即使是空数组） - -### 检查前端 -访问: http://localhost:3000 - -应该看到登录页面 - ---- - -## 常见问题 - -### 1. 端口被占用 -```bash -# Windows查看端口占用 -netstat -ano | findstr :8080 -netstat -ano | findstr :3000 - -# 结束进程 -taskkill /PID <进程ID> /F -``` - -### 2. 后端启动失败 -- 检查MySQL是否已启动 -- 检查`application.yml`中的数据库配置 -- 确认数据库已创建 - -### 3. 前端启动失败 -- 删除`node_modules`文件夹，重新`npm install` -- 检查Node.js版本是否为18+ - -### 4. Maven依赖下载慢 -编辑 `backend/pom.xml`，添加国内镜像： -```xml - - - aliyun - https://maven.aliyun.com/repository/public - - -``` - ---- - -## 开发工具建议 - -### 后端开发 -- **IntelliJ IDEA** (推荐) -- **Eclipse** with Spring Tools - -### 前端开发 -- **VS Code** (推荐) - - 安装插件: Vue Language Features (Volar) - - 安装插件: ESLint - ---- - -## 下一步 - -1. 使用默认账号登录系统 -2. 创建第一个查询请求 -3. 配置知识库 -4. 配置Dify API和大模型API - -详细文档请参考： -- [PROJECT_STRUCTURE.md](./PROJECT_STRUCTURE.md) - 项目结构 -- [DEPLOYMENT.md](./DEPLOYMENT.md) - 完整部署指南 - - - - diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/config/SecurityConfig.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/config/SecurityConfig.java index 515aa6f..3c7ecc0 100644 --- a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/config/SecurityConfig.java +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/config/SecurityConfig.java @@ -11,6 +11,7 @@ import org.springframework.security.web.SecurityFilterChain; import org.springframework.web.cors.CorsConfiguration; import org.springframework.web.cors.CorsConfigurationSource; import org.springframework.web.cors.UrlBasedCorsConfigurationSource; +import org.springframework.web.reactive.function.client.WebClient; import java.util.Arrays; @@ -54,4 +55,10 @@ public class SecurityConfig { public PasswordEncoder passwordEncoder() { return new BCryptPasswordEncoder(); } + + @Bean + public WebClient.Builder webClientBuilder() { + return WebClient.builder() + .codecs(configurer -> configurer.defaultCodecs().maxInMemorySize(10 * 1024 * 1024)); // 10MB buffer + } } diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/DrugController.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/DrugController.java new file mode 100644 index 0000000..f8f8117 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/DrugController.java @@ -0,0 +1,153 @@ +package com.ipsen.medical.controller; + +import com.ipsen.medical.dto.ApiResponse; +import com.ipsen.medical.dto.DrugDTO; +import com.ipsen.medical.dto.DrugSafetyInfoDTO; +import com.ipsen.medical.service.DrugService; +import lombok.RequiredArgsConstructor; +import org.springframework.http.ResponseEntity; +import org.springframework.web.bind.annotation.*; + +import java.util.List; + +/** + * 药物信息控制器 + */ +@RestController +@RequestMapping("/drugs") +@RequiredArgsConstructor +@CrossOrigin(origins = "*") +public class DrugController { + + private final DrugService drugService; + + /** + * 获取所有药物列表 + */ + @GetMapping + public ResponseEntity>> getAllDrugs() { + List drugs = drugService.getAllDrugs(); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(drugs)); + } + + /** + * 根据ID获取药物详情（包含所有安全信息） + */ + @GetMapping("/{id}") + public ResponseEntity> getDrugById(@PathVariable Long id) { + DrugDTO drug = drugService.getDrugById(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(drug)); + } + + /** + * 根据药物编码获取药物详情 + */ + @GetMapping("/code/{drugCode}") + public ResponseEntity> getDrugByCode(@PathVariable String drugCode) { + DrugDTO drug = drugService.getDrugByCode(drugCode); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(drug)); + } + + /** + * 搜索药物 + */ + @GetMapping("/search") + public ResponseEntity>> searchDrugs(@RequestParam String keyword) { + List drugs = drugService.searchDrugs(keyword); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(drugs)); + } + + /** + * 创建药物 + */ + @PostMapping + public ResponseEntity> createDrug(@RequestBody DrugDTO drugDTO) { + DrugDTO created = drugService.createDrug(drugDTO); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(created)); + } + + /** + * 更新药物 + */ + @PutMapping("/{id}") + public ResponseEntity> updateDrug( + @PathVariable Long id, + @RequestBody DrugDTO drugDTO) { + DrugDTO updated = drugService.updateDrug(id, drugDTO); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(updated)); + } + + /** + * 删除药物 + */ + @DeleteMapping("/{id}") + public ResponseEntity> deleteDrug(@PathVariable Long id) { + drugService.deleteDrug(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(null)); + } + + /** + * 获取药物的所有安全信息 + */ + @GetMapping("/{id}/safety-infos") + public ResponseEntity>> getDrugSafetyInfos( + @PathVariable Long id) { + List safetyInfos = drugService.getDrugSafetyInfos(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(safetyInfos)); + } + + /** + * 根据来源获取安全信息 + */ + @GetMapping("/{id}/safety-infos/source/{source}") + public ResponseEntity>> getDrugSafetyInfosBySource( + @PathVariable Long id, + @PathVariable String source) { + List safetyInfos = drugService.getDrugSafetyInfosBySource(id, source); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(safetyInfos)); + } + + /** + * 添加安全信息 + */ + @PostMapping("/{id}/safety-infos") + public ResponseEntity> addSafetyInfo( + @PathVariable Long id, + @RequestBody DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO) { + DrugSafetyInfoDTO created = drugService.addSafetyInfo(id, safetyInfoDTO); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(created)); + } + + /** + * 更新安全信息 + */ + @PutMapping("/safety-infos/{safetyInfoId}") + public ResponseEntity> updateSafetyInfo( + @PathVariable Long safetyInfoId, + @RequestBody DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO) { + DrugSafetyInfoDTO updated = drugService.updateSafetyInfo(safetyInfoId, safetyInfoDTO); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(updated)); + } + + /** + * 删除安全信息 + */ + @DeleteMapping("/safety-infos/{safetyInfoId}") + public ResponseEntity> deleteSafetyInfo(@PathVariable Long safetyInfoId) { + drugService.deleteSafetyInfo(safetyInfoId); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(null)); + } + + /** + * 验证安全信息 + */ + @PostMapping("/safety-infos/{safetyInfoId}/verify") + public ResponseEntity> verifySafetyInfo( + @PathVariable Long safetyInfoId, + @RequestParam String verifiedBy) { + DrugSafetyInfoDTO verified = drugService.verifySafetyInfo(safetyInfoId, verifiedBy); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(verified)); + } +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/InquiryController.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/InquiryController.java index 49362e8..f8e3dea 100644 --- a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/InquiryController.java +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/controller/InquiryController.java @@ -1,9 +1,14 @@ package com.ipsen.medical.controller; import com.ipsen.medical.dto.ApiResponse; +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialDTO; import com.ipsen.medical.dto.InquiryRequestDTO; +import com.ipsen.medical.service.AutoSearchService; +import com.ipsen.medical.service.ClinicalTrialsService; import com.ipsen.medical.service.InquiryService; import lombok.RequiredArgsConstructor; +import org.springframework.http.HttpHeaders; +import org.springframework.http.MediaType; import org.springframework.http.ResponseEntity; import org.springframework.web.bind.annotation.*; import org.springframework.web.multipart.MultipartFile; @@ -20,6 +25,8 @@ import java.util.List; public class InquiryController { private final InquiryService inquiryService; + private final ClinicalTrialsService clinicalTrialsService; + private final AutoSearchService autoSearchService; /** * 上传查询表格 @@ -107,6 +114,73 @@ public class InquiryController { InquiryRequestDTO result = inquiryService.completeInquiry(id); return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(result)); } + + /** + * 搜索临床试验 + */ + @PostMapping("/{id}/clinical-trials/search") + public ResponseEntity>> searchClinicalTrials( + @PathVariable Long id, + @RequestParam String keyword) { + List results = clinicalTrialsService.searchAndSaveForInquiry(id, keyword); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(results)); + } + + /** + * 获取查询请求的临床试验列表 + */ + @GetMapping("/{id}/clinical-trials") + public ResponseEntity>> getClinicalTrials(@PathVariable Long id) { + List results = clinicalTrialsService.getClinicalTrialsByInquiry(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(results)); + } + + /** + * 导出临床试验为CSV + */ + @GetMapping("/{id}/clinical-trials/export") + public ResponseEntity exportClinicalTrialsToCsv(@PathVariable Long id) { + byte[] csvData = clinicalTrialsService.exportToCsv(id); + + HttpHeaders headers = new HttpHeaders(); + headers.setContentType(MediaType.parseMediaType("text/csv")); + headers.setContentDispositionFormData("attachment", "clinical_trials_" + id + ".csv"); + + return ResponseEntity.ok() + .headers(headers) + .body(csvData); + } + + /** + * 删除查询请求的临床试验数据 + */ + @DeleteMapping("/{id}/clinical-trials") + public ResponseEntity> deleteClinicalTrials(@PathVariable Long id) { + clinicalTrialsService.deleteClinicalTrials(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(null)); + } + + /** + * 基于AI识别的关键词执行自动检索 + * 包括：临床试验、文献数据库等 + */ + @PostMapping("/{id}/auto-search") + public ResponseEntity> performAutoSearch(@PathVariable Long id) { + InquiryRequestDTO result = autoSearchService.performAutoSearch(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(result)); + } + + /** + * 执行完整的AI工作流 + * 1. 提取关键词 + * 2. 自动检索（临床试验、知识库） + * 3. 生成回复 + */ + @PostMapping("/{id}/full-workflow") + public ResponseEntity> executeFullWorkflow(@PathVariable Long id) { + InquiryRequestDTO result = autoSearchService.executeFullWorkflow(id); + return ResponseEntity.ok(ApiResponse.success(result)); + } } diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialDTO.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialDTO.java new file mode 100644 index 0000000..e66e290 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialDTO.java @@ -0,0 +1,50 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; +import java.util.List; + +/** + * 临床试验数据传输对象 + */ +@Data +public class ClinicalTrialDTO { + + private Long id; + private Long inquiryId; + private String nctId; + private String studyTitle; + private String briefTitle; + private String officialTitle; + private String overallStatus; + private String startDate; + private String completionDate; + private String studyType; + private String phase; + private Integer enrollment; + private List conditions; + private List interventions; + private String sponsor; + private List collaborators; + private List locations; + private String briefSummary; + private String detailedDescription; + private String primaryOutcome; + private String secondaryOutcome; + private String eligibilityCriteria; + private String url; + private LocalDateTime createdAt; + + @Data + public static class LocationInfo { + private String facility; + private String city; + private String state; + private String country; + private String status; + } +} + + + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialsSearchResult.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialsSearchResult.java new file mode 100644 index 0000000..42673df --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/ClinicalTrialsSearchResult.java @@ -0,0 +1,29 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import lombok.Data; +import java.util.List; + +/** + * 临床试验搜索结果 + */ +@Data +public class ClinicalTrialsSearchResult { + + private String searchTerm; // 搜索关键词 + private Integer totalCount; // 总结果数 + private List studies; // 研究列表 + private String nextPageToken; // 下一页token（如果有分页） + + public ClinicalTrialsSearchResult() { + } + + public ClinicalTrialsSearchResult(String searchTerm, Integer totalCount, List studies) { + this.searchTerm = searchTerm; + this.totalCount = totalCount; + this.studies = studies; + } +} + + + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyRequest.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyRequest.java new file mode 100644 index 0000000..5963a7f --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyRequest.java @@ -0,0 +1,41 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonProperty; +import lombok.Data; + +import java.util.Map; + +/** + * Dify API请求 + */ +@Data +public class DifyRequest { + + /** + * 输入内容 + */ + private Map inputs; + + /** + * 查询内容 + */ + private String query; + + /** + * 响应模式: blocking（同步）, streaming（流式） + */ + @JsonProperty("response_mode") + private String responseMode = "blocking"; + + /** + * 会话ID（可选） + */ + @JsonProperty("conversation_id") + private String conversationId; + + /** + * 用户标识 + */ + private String user; +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyResponse.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyResponse.java new file mode 100644 index 0000000..6700ab2 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DifyResponse.java @@ -0,0 +1,58 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import com.fasterxml.jackson.annotation.JsonProperty; +import lombok.Data; + +import java.util.Map; + +/** + * Dify API响应 + */ +@Data +public class DifyResponse { + + /** + * 事件类型 + */ + private String event; + + /** + * 任务ID + */ + @JsonProperty("task_id") + private String taskId; + + /** + * 消息ID + */ + @JsonProperty("message_id") + private String messageId; + + /** + * 会话ID + */ + @JsonProperty("conversation_id") + private String conversationId; + + /** + * 模式 + */ + private String mode; + + /** + * 回答内容 + */ + private String answer; + + /** + * 元数据 + */ + private Map metadata; + + /** + * 创建时间 + */ + @JsonProperty("created_at") + private Long createdAt; +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugDTO.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugDTO.java new file mode 100644 index 0000000..3a008bd --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugDTO.java @@ -0,0 +1,28 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; +import java.util.List; + +@Data +public class DrugDTO { + private Long id; + private String drugCode; + private String genericName; + private String tradeName; + private String activeIngredient; + private String description; + private String manufacturer; + private String approvalNumber; + private String indications; + private String dosageAndAdministration; + private String contraindications; + private String therapeuticClass; + private String atcCode; + private String status; + private LocalDateTime createdAt; + private LocalDateTime updatedAt; + private List safetyInfos; +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugSafetyInfoDTO.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugSafetyInfoDTO.java new file mode 100644 index 0000000..fc55909 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/DrugSafetyInfoDTO.java @@ -0,0 +1,27 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; + +@Data +public class DrugSafetyInfoDTO { + private Long id; + private Long drugId; + private String source; // INTERNAL, LITERATURE, REGULATORY, SOCIAL_MEDIA, CLINICAL_TRIAL + private String title; + private String content; + private String category; // 安全信息分类 + private String severityLevel; // MILD, MODERATE, SEVERE, CRITICAL + private String referenceUrl; + private String referenceDocument; + private String reportedBy; + private LocalDateTime reportedAt; + private String additionalInfo; + private Boolean verified; + private String verifiedBy; + private LocalDateTime verifiedAt; + private LocalDateTime createdAt; + private LocalDateTime updatedAt; +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/KeywordExtractionResult.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/KeywordExtractionResult.java new file mode 100644 index 0000000..43f2270 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/dto/KeywordExtractionResult.java @@ -0,0 +1,31 @@ +package com.ipsen.medical.dto; + +import lombok.Data; + +/** + * AI关键词提取结果 + */ +@Data +public class KeywordExtractionResult { + + /** + * 药物中文名称 + */ + private String drugNameChinese; + + /** + * 药物英文名称 + */ + private String drugNameEnglish; + + /** + * 查询项目/问题 + */ + private String requestItem; + + /** + * 置信度 + */ + private Double confidence; +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/ClinicalTrial.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/ClinicalTrial.java new file mode 100644 index 0000000..adb72cd --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/ClinicalTrial.java @@ -0,0 +1,106 @@ +package com.ipsen.medical.entity; + +import javax.persistence.*; +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; + +/** + * 临床试验实体 + */ +@Data +@Entity +@Table(name = "clinical_trials", + uniqueConstraints = @UniqueConstraint(columnNames = {"inquiry_id", "nct_id"})) +public class ClinicalTrial { + + @Id + @GeneratedValue(strategy = GenerationType.IDENTITY) + private Long id; + + @Column(name = "inquiry_id") + private Long inquiryId; // 关联的查询请求ID + + @Column(name = "nct_id") + private String nctId; // NCT编号（ClinicalTrials.gov的唯一标识） + + @Column(name = "study_title", columnDefinition = "TEXT") + private String studyTitle; // 研究标题 + + @Column(name = "brief_title") + private String briefTitle; // 简短标题 + + @Column(name = "official_title", columnDefinition = "TEXT") + private String officialTitle; // 官方标题 + + @Column(name = "overall_status") + private String overallStatus; // 研究状态 + + @Column(name = "start_date") + private String startDate; // 开始日期 + + @Column(name = "completion_date") + private String completionDate; // 完成日期 + + @Column(name = "study_type") + private String studyType; // 研究类型 + + @Column(name = "phase") + private String phase; // 研究阶段 + + @Column(name = "enrollment") + private Integer enrollment; // 入组人数 + + @Column(name = "conditions", columnDefinition = "TEXT") + private String conditions; // 适应症（JSON数组） + + @Column(name = "interventions", columnDefinition = "TEXT") + private String interventions; // 干预措施（JSON数组） + + @Column(name = "sponsor") + private String sponsor; // 主要研究者/机构 + + @Column(name = "collaborators", columnDefinition = "TEXT") + private String collaborators; // 合作者（JSON数组） + + @Column(name = "locations", columnDefinition = "TEXT") + private String locations; // 研究地点（JSON数组） + + @Column(name = "brief_summary", columnDefinition = "TEXT") + private String briefSummary; // 简要摘要 + + @Column(name = "detailed_description", columnDefinition = "TEXT") + private String detailedDescription; // 详细描述 + + @Column(name = "primary_outcome", columnDefinition = "TEXT") + private String primaryOutcome; // 主要终点 + + @Column(name = "secondary_outcome", columnDefinition = "TEXT") + private String secondaryOutcome; // 次要终点 + + @Column(name = "eligibility_criteria", columnDefinition = "TEXT") + private String eligibilityCriteria; // 入选标准 + + @Column(name = "url") + private String url; // ClinicalTrials.gov链接 + + @Column(name = "raw_data", columnDefinition = "LONGTEXT") + private String rawData; // 原始API返回数据（JSON格式） + + @Column(name = "created_at", nullable = false) + private LocalDateTime createdAt; + + @Column(name = "updated_at") + private LocalDateTime updatedAt; + + @PrePersist + protected void onCreate() { + createdAt = LocalDateTime.now(); + } + + @PreUpdate + protected void onUpdate() { + updatedAt = LocalDateTime.now(); + } +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/Drug.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/Drug.java new file mode 100644 index 0000000..49f23bc --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/Drug.java @@ -0,0 +1,81 @@ +package com.ipsen.medical.entity; + +import javax.persistence.*; +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; +import java.util.List; + +/** + * 药物实体 + */ +@Data +@Entity +@Table(name = "drugs") +public class Drug { + + @Id + @GeneratedValue(strategy = GenerationType.IDENTITY) + private Long id; + + @Column(nullable = false, unique = true) + private String drugCode; // 药物编码 + + @Column(nullable = false) + private String genericName; // 通用名 + + private String tradeName; // 商品名 + + private String activeIngredient; // 活性成分 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String description; // 药物描述 + + private String manufacturer; // 生产厂家 + + private String approvalNumber; // 批准文号 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String indications; // 适应症 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String dosageAndAdministration; // 用法用量 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String contraindications; // 禁忌症 + + private String therapeuticClass; // 治疗分类 + + private String atcCode; // ATC编码 + + @Enumerated(EnumType.STRING) + private DrugStatus status; // 药物状态 + + @Column(nullable = false) + private LocalDateTime createdAt; + + private LocalDateTime updatedAt; + + @OneToMany(mappedBy = "drug", cascade = CascadeType.ALL, orphanRemoval = true) + private List safetyInfos; + + @PrePersist + protected void onCreate() { + createdAt = LocalDateTime.now(); + if (status == null) { + status = DrugStatus.ACTIVE; + } + } + + @PreUpdate + protected void onUpdate() { + updatedAt = LocalDateTime.now(); + } + + public enum DrugStatus { + ACTIVE, // 在市 + SUSPENDED, // 暂停 + WITHDRAWN // 撤市 + } +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/DrugSafetyInfo.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/DrugSafetyInfo.java new file mode 100644 index 0000000..3fdf0f4 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/entity/DrugSafetyInfo.java @@ -0,0 +1,118 @@ +package com.ipsen.medical.entity; + +import javax.persistence.*; +import lombok.Data; +import java.time.LocalDateTime; + +/** + * 药物安全信息实体 + * 包括内部数据、文献数据、监管数据、自媒体数据 + */ +@Data +@Entity +@Table(name = "drug_safety_infos") +public class DrugSafetyInfo { + + @Id + @GeneratedValue(strategy = GenerationType.IDENTITY) + private Long id; + + @ManyToOne + @JoinColumn(name = "drug_id", nullable = false) + private Drug drug; + + @Enumerated(EnumType.STRING) + @Column(nullable = false) + private InfoSource source; // 信息来源类型 + + @Column(nullable = false) + private String title; // 标题 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String content; // 内容详情 + + @Enumerated(EnumType.STRING) + @Column(nullable = false) + private SafetyCategory category; // 安全信息分类 + + @Enumerated(EnumType.STRING) + private SeverityLevel severityLevel; // 严重程度 + + private String referenceUrl; // 参考链接 + + private String referenceDocument; // 参考文档 + + private String reportedBy; // 报告来源 + + private LocalDateTime reportedAt; // 报告时间 + + @Column(columnDefinition = "TEXT") + private String additionalInfo; // 附加信息（JSON格式） + + private Boolean verified; // 是否已验证 + + private String verifiedBy; // 验证人 + + private LocalDateTime verifiedAt; // 验证时间 + + @Column(nullable = false) + private LocalDateTime createdAt; + + private LocalDateTime updatedAt; + + @PrePersist + protected void onCreate() { + createdAt = LocalDateTime.now(); + if (verified == null) { + verified = false; + } + } + + @PreUpdate + protected void onUpdate() { + updatedAt = LocalDateTime.now(); + } + + /** + * 信息来源类型 + */ + public enum InfoSource { + INTERNAL, // 内部数据 + LITERATURE, // 文献数据 + REGULATORY, // 监管公开信息 + SOCIAL_MEDIA, // 自媒体信息 + CLINICAL_TRIAL // 临床试验 + } + + /** + * 安全信息分类 + */ + public enum SafetyCategory { + ADVERSE_REACTION, // 不良反应 + DRUG_INTERACTION, // 药物相互作用 + CONTRAINDICATION, // 禁忌症 + SPECIAL_POPULATION, // 特殊人群用药 + OVERDOSE, // 过量 + WITHDRAWAL_SYMPTOM, // 停药症状 + LONG_TERM_EFFECT, // 长期使用影响 + PREGNANCY_LACTATION, // 妊娠哺乳期用药 + PEDIATRIC_USE, // 儿童用药 + GERIATRIC_USE, // 老年用药 + HEPATIC_IMPAIRMENT, // 肝功能不全 + RENAL_IMPAIRMENT, // 肾功能不全 + PRECAUTION, // 注意事项 + WARNING // 警告信息 + } + + /** + * 严重程度 + */ + public enum SeverityLevel { + MILD, // 轻度 + MODERATE, // 中度 + SEVERE, // 重度 + CRITICAL // 严重/致命 + } +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/ClinicalTrialRepository.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/ClinicalTrialRepository.java new file mode 100644 index 0000000..d0e0dd5 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/ClinicalTrialRepository.java @@ -0,0 +1,39 @@ +package com.ipsen.medical.repository; + +import com.ipsen.medical.entity.ClinicalTrial; +import org.springframework.data.jpa.repository.JpaRepository; +import org.springframework.stereotype.Repository; + +import java.util.List; +import java.util.Optional; + +/** + * 临床试验数据仓库 + */ +@Repository +public interface ClinicalTrialRepository extends JpaRepository { + + /** + * 根据查询请求ID查找临床试验 + */ + List findByInquiryId(Long inquiryId); + + /** + * 根据NCT ID查找 + */ + Optional findByNctId(String nctId); + + /** + * 根据查询请求ID和NCT ID查找 + */ + Optional findByInquiryIdAndNctId(Long inquiryId, String nctId); + + /** + * 删除指定查询请求的所有临床试验数据 + */ + void deleteByInquiryId(Long inquiryId); +} + + + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugRepository.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugRepository.java new file mode 100644 index 0000000..10e1269 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugRepository.java @@ -0,0 +1,28 @@ +package com.ipsen.medical.repository; + +import com.ipsen.medical.entity.Drug; +import org.springframework.data.jpa.repository.JpaRepository; +import org.springframework.data.jpa.repository.Query; +import org.springframework.data.repository.query.Param; +import org.springframework.stereotype.Repository; + +import java.util.List; +import java.util.Optional; + +@Repository +public interface DrugRepository extends JpaRepository { + + Optional findByDrugCode(String drugCode); + + List findByStatus(Drug.DrugStatus status); + + @Query("SELECT d FROM Drug d WHERE " + + "LOWER(d.genericName) LIKE LOWER(CONCAT('%', :keyword, '%')) OR " + + "LOWER(d.tradeName) LIKE LOWER(CONCAT('%', :keyword, '%')) OR " + + "LOWER(d.activeIngredient) LIKE LOWER(CONCAT('%', :keyword, '%'))") + List searchDrugs(@Param("keyword") String keyword); + + List findByTherapeuticClass(String therapeuticClass); +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugSafetyInfoRepository.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugSafetyInfoRepository.java new file mode 100644 index 0000000..c3828b4 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/repository/DrugSafetyInfoRepository.java @@ -0,0 +1,21 @@ +package com.ipsen.medical.repository; + +import com.ipsen.medical.entity.DrugSafetyInfo; +import org.springframework.data.jpa.repository.JpaRepository; +import org.springframework.stereotype.Repository; + +import java.util.List; + +@Repository +public interface DrugSafetyInfoRepository extends JpaRepository { + + List findByDrugId(Long drugId); + + List findByDrugIdAndSource(Long drugId, DrugSafetyInfo.InfoSource source); + + List findByDrugIdAndCategory(Long drugId, DrugSafetyInfo.SafetyCategory category); + + List findByDrugIdAndVerified(Long drugId, Boolean verified); +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/AutoSearchService.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/AutoSearchService.java new file mode 100644 index 0000000..a32e500 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/AutoSearchService.java @@ -0,0 +1,24 @@ +package com.ipsen.medical.service; + +import com.ipsen.medical.dto.InquiryRequestDTO; + +/** + * 自动检索服务接口 + */ +public interface AutoSearchService { + + /** + * 基于AI识别的关键词执行自动检索 + * 包括：临床试验、文献数据库等 + */ + InquiryRequestDTO performAutoSearch(Long inquiryId); + + /** + * 执行完整的AI工作流 + * 1. 提取关键词 + * 2. 自动检索 + * 3. 生成回复 + */ + InquiryRequestDTO executeFullWorkflow(Long inquiryId); +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/ClinicalTrialsService.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/ClinicalTrialsService.java new file mode 100644 index 0000000..d9f6753 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/ClinicalTrialsService.java @@ -0,0 +1,52 @@ +package com.ipsen.medical.service; + +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialDTO; +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialsSearchResult; + +import java.util.List; + +/** + * 临床试验服务接口 + */ +public interface ClinicalTrialsService { + + /** + * 根据关键词搜索临床试验 + * @param keyword 搜索关键词（通常是药品名称） + * @param pageSize 每页数量 + * @return 搜索结果 + */ + ClinicalTrialsSearchResult searchClinicalTrials(String keyword, Integer pageSize); + + /** + * 为指定查询请求搜索并保存临床试验数据 + * @param inquiryId 查询请求ID + * @param keyword 搜索关键词 + * @return 找到的临床试验列表 + */ + List searchAndSaveForInquiry(Long inquiryId, String keyword); + + /** + * 获取指定查询请求的所有临床试验 + * @param inquiryId 查询请求ID + * @return 临床试验列表 + */ + List getClinicalTrialsByInquiry(Long inquiryId); + + /** + * 导出临床试验数据为CSV格式 + * @param inquiryId 查询请求ID + * @return CSV内容（字节数组） + */ + byte[] exportToCsv(Long inquiryId); + + /** + * 删除指定查询请求的临床试验数据 + * @param inquiryId 查询请求ID + */ + void deleteClinicalTrials(Long inquiryId); +} + + + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DifyService.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DifyService.java index fd7e360..39678c5 100644 --- a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DifyService.java +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DifyService.java @@ -1,12 +1,19 @@ package com.ipsen.medical.service; +import com.ipsen.medical.dto.KeywordExtractionResult; + /** * Dify AI服务接口 */ public interface DifyService { /** - * 提取关键词 + * 提取关键词（返回结构化数据） + */ + KeywordExtractionResult extractKeywordsStructured(String content); + + /** + * 提取关键词（返回JSON字符串） */ String extractKeywords(String content); diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DrugService.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DrugService.java new file mode 100644 index 0000000..6080ec2 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/DrugService.java @@ -0,0 +1,76 @@ +package com.ipsen.medical.service; + +import com.ipsen.medical.dto.DrugDTO; +import com.ipsen.medical.dto.DrugSafetyInfoDTO; + +import java.util.List; + +public interface DrugService { + + /** + * 获取所有药物列表 + */ + List getAllDrugs(); + + /** + * 根据ID获取药物详情 + */ + DrugDTO getDrugById(Long id); + + /** + * 根据药物编码获取药物详情 + */ + DrugDTO getDrugByCode(String drugCode); + + /** + * 搜索药物 + */ + List searchDrugs(String keyword); + + /** + * 创建药物 + */ + DrugDTO createDrug(DrugDTO drugDTO); + + /** + * 更新药物 + */ + DrugDTO updateDrug(Long id, DrugDTO drugDTO); + + /** + * 删除药物 + */ + void deleteDrug(Long id); + + /** + * 获取药物的所有安全信息 + */ + List getDrugSafetyInfos(Long drugId); + + /** + * 根据来源获取安全信息 + */ + List getDrugSafetyInfosBySource(Long drugId, String source); + + /** + * 添加安全信息 + */ + DrugSafetyInfoDTO addSafetyInfo(Long drugId, DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO); + + /** + * 更新安全信息 + */ + DrugSafetyInfoDTO updateSafetyInfo(Long safetyInfoId, DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO); + + /** + * 删除安全信息 + */ + void deleteSafetyInfo(Long safetyInfoId); + + /** + * 验证安全信息 + */ + DrugSafetyInfoDTO verifySafetyInfo(Long safetyInfoId, String verifiedBy); +} + + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/AutoSearchServiceImpl.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/AutoSearchServiceImpl.java new file mode 100644 index 0000000..7085c59 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/AutoSearchServiceImpl.java @@ -0,0 +1,209 @@ +package com.ipsen.medical.service.impl; + +import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper; +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialDTO; +import com.ipsen.medical.dto.InquiryRequestDTO; +import com.ipsen.medical.dto.KeywordExtractionResult; +import com.ipsen.medical.entity.InquiryRequest; +import com.ipsen.medical.repository.InquiryRequestRepository; +import com.ipsen.medical.service.AutoSearchService; +import com.ipsen.medical.service.ClinicalTrialsService; +import com.ipsen.medical.service.DifyService; +import lombok.RequiredArgsConstructor; +import lombok.extern.slf4j.Slf4j; +import org.springframework.stereotype.Service; +import org.springframework.transaction.annotation.Transactional; + +import java.time.LocalDateTime; +import java.util.HashMap; +import java.util.List; +import java.util.Map; + +/** + * 自动检索服务实现 + */ +@Slf4j +@Service +@RequiredArgsConstructor +public class AutoSearchServiceImpl implements AutoSearchService { + + private final InquiryRequestRepository inquiryRequestRepository; + private final DifyService difyService; + private final ClinicalTrialsService clinicalTrialsService; + private final ObjectMapper objectMapper; + + @Override + @Transactional + public InquiryRequestDTO performAutoSearch(Long inquiryId) { + log.info("Starting auto search for inquiry: {}", inquiryId); + + InquiryRequest inquiry = inquiryRequestRepository.findById(inquiryId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("查询请求不存在: " + inquiryId)); + + try { + // 1. 解析已提取的关键词 + KeywordExtractionResult keywords = parseKeywords(inquiry.getKeywords()); + + if (keywords == null || keywords.getDrugNameEnglish() == null) { + throw new RuntimeException("未找到有效的关键词，请先提取关键词"); + } + + log.info("Using keywords for search: Chinese={}, English={}", + keywords.getDrugNameChinese(), keywords.getDrugNameEnglish()); + + // 2. 使用英文药物名称搜索临床试验 + List clinicalTrials = null; + try { + log.info("Searching clinical trials with keyword: {}", keywords.getDrugNameEnglish()); + clinicalTrials = clinicalTrialsService.searchAndSaveForInquiry( + inquiryId, + keywords.getDrugNameEnglish() + ); + log.info("Found {} clinical trials", clinicalTrials != null ? clinicalTrials.size() : 0); + } catch (Exception e) { + log.error("Error searching clinical trials: ", e); + } + + // 3. 使用Dify搜索知识库 + String knowledgeBaseResults = null; + try { + String searchQuery = buildSearchQuery(keywords); + log.info("Searching knowledge base with query: {}", searchQuery); + knowledgeBaseResults = difyService.performSearch(searchQuery); + } catch (Exception e) { + log.error("Error searching knowledge base: ", e); + } + + // 4. 整合检索结果 + Map searchResults = new HashMap<>(); + searchResults.put("keywords", keywords); + searchResults.put("clinicalTrialsCount", clinicalTrials != null ? clinicalTrials.size() : 0); + searchResults.put("knowledgeBaseResults", knowledgeBaseResults); + searchResults.put("searchTime", LocalDateTime.now().toString()); + + String searchResultsJson = objectMapper.writeValueAsString(searchResults); + + // 5. 更新查询请求 + inquiry.setSearchResults(searchResultsJson); + inquiry.setStatus(InquiryRequest.RequestStatus.SEARCH_COMPLETED); + inquiry.setUpdatedAt(LocalDateTime.now()); + + InquiryRequest savedInquiry = inquiryRequestRepository.save(inquiry); + + log.info("Auto search completed for inquiry: {}", inquiryId); + + return convertToDTO(savedInquiry); + + } catch (Exception e) { + log.error("Error performing auto search: ", e); + throw new RuntimeException("自动检索失败: " + e.getMessage(), e); + } + } + + @Override + @Transactional + public InquiryRequestDTO executeFullWorkflow(Long inquiryId) { + log.info("Executing full AI workflow for inquiry: {}", inquiryId); + + try { + InquiryRequest inquiry = inquiryRequestRepository.findById(inquiryId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("查询请求不存在: " + inquiryId)); + + // 步骤1: 提取关键词 + log.info("Step 1: Extracting keywords"); + KeywordExtractionResult keywords = difyService.extractKeywordsStructured(inquiry.getInquiryContent()); + String keywordsJson = objectMapper.writeValueAsString(keywords); + inquiry.setKeywords(keywordsJson); + inquiry.setStatus(InquiryRequest.RequestStatus.KEYWORD_EXTRACTED); + inquiry.setUpdatedAt(LocalDateTime.now()); + inquiryRequestRepository.save(inquiry); + + // 步骤2: 自动检索 + log.info("Step 2: Performing auto search"); + performAutoSearch(inquiryId); + + // 步骤3: 生成回复（可选） + inquiry = inquiryRequestRepository.findById(inquiryId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("查询请求不存在: " + inquiryId)); + try { + log.info("Step 3: Generating response"); + String response = difyService.generateResponse( + inquiry.getInquiryContent(), + inquiry.getSearchResults() + ); + inquiry.setResponseContent(response); + inquiry.setStatus(InquiryRequest.RequestStatus.UNDER_REVIEW); + inquiry.setUpdatedAt(LocalDateTime.now()); + inquiryRequestRepository.save(inquiry); + } catch (Exception e) { + log.error("Error generating response: ", e); + // 继续执行，不中断流程 + } + + log.info("Full workflow completed for inquiry: {}", inquiryId); + + return convertToDTO(inquiry); + + } catch (Exception e) { + log.error("Error executing full workflow: ", e); + throw new RuntimeException("完整工作流执行失败: " + e.getMessage(), e); + } + } + + /** + * 解析关键词JSON + */ + private KeywordExtractionResult parseKeywords(String keywordsJson) { + try { + if (keywordsJson == null || keywordsJson.isEmpty()) { + return null; + } + return objectMapper.readValue(keywordsJson, KeywordExtractionResult.class); + } catch (Exception e) { + log.error("Error parsing keywords: ", e); + return null; + } + } + + /** + * 构建搜索查询 + */ + private String buildSearchQuery(KeywordExtractionResult keywords) { + StringBuilder query = new StringBuilder(); + + if (keywords.getDrugNameChinese() != null) { + query.append(keywords.getDrugNameChinese()).append(" "); + } + if (keywords.getDrugNameEnglish() != null) { + query.append(keywords.getDrugNameEnglish()).append(" "); + } + if (keywords.getRequestItem() != null) { + query.append(keywords.getRequestItem()); + } + + return query.toString().trim(); + } + + /** + * 转换为DTO + */ + private InquiryRequestDTO convertToDTO(InquiryRequest inquiry) { + InquiryRequestDTO dto = new InquiryRequestDTO(); + dto.setId(inquiry.getId()); + dto.setRequestNumber(inquiry.getRequestNumber()); + dto.setCustomerName(inquiry.getCustomerName()); + dto.setCustomerEmail(inquiry.getCustomerEmail()); + dto.setCustomerTitle(inquiry.getCustomerTitle()); + dto.setInquiryContent(inquiry.getInquiryContent()); + dto.setKeywords(inquiry.getKeywords()); + dto.setStatus(inquiry.getStatus().name()); + dto.setSearchResults(inquiry.getSearchResults()); + dto.setResponseContent(inquiry.getResponseContent()); + dto.setAssignedTo(inquiry.getAssignedTo()); + dto.setCreatedAt(inquiry.getCreatedAt()); + dto.setUpdatedAt(inquiry.getUpdatedAt()); + dto.setCompletedAt(inquiry.getCompletedAt()); + return dto; + } +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/ClinicalTrialsServiceImpl.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/ClinicalTrialsServiceImpl.java new file mode 100644 index 0000000..9d70078 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/ClinicalTrialsServiceImpl.java @@ -0,0 +1,442 @@ +package com.ipsen.medical.service.impl; + +import com.fasterxml.jackson.databind.JsonNode; +import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper; +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialDTO; +import com.ipsen.medical.dto.ClinicalTrialsSearchResult; +import com.ipsen.medical.entity.ClinicalTrial; +import com.ipsen.medical.repository.ClinicalTrialRepository; +import com.ipsen.medical.service.ClinicalTrialsService; +import lombok.RequiredArgsConstructor; +import lombok.extern.slf4j.Slf4j; +import org.springframework.stereotype.Service; +import org.springframework.transaction.annotation.Transactional; +import org.springframework.web.reactive.function.client.WebClient; + +import java.io.ByteArrayOutputStream; +import java.io.OutputStreamWriter; +import java.nio.charset.StandardCharsets; +import java.util.ArrayList; +import java.util.List; +import java.util.stream.Collectors; + +/** + * 临床试验服务实现 + * 使用 ClinicalTrials.gov API v2 + * API文档: https://clinicaltrials.gov/data-api/about-api + */ +@Slf4j +@Service +@RequiredArgsConstructor +public class ClinicalTrialsServiceImpl implements ClinicalTrialsService { + + private static final String API_BASE_URL = "https://clinicaltrials.gov/api/v2"; + private static final Integer DEFAULT_PAGE_SIZE = 50; + + private final ClinicalTrialRepository clinicalTrialRepository; + private final ObjectMapper objectMapper; + private final WebClient.Builder webClientBuilder; + + @Override + public ClinicalTrialsSearchResult searchClinicalTrials(String keyword, Integer pageSize) { + log.info("Searching clinical trials for keyword: {}", keyword); + + final int finalPageSize = (pageSize == null || pageSize <= 0) ? DEFAULT_PAGE_SIZE : pageSize; + + try { + WebClient webClient = webClientBuilder.baseUrl(API_BASE_URL).build(); + + // 调用 ClinicalTrials.gov API v2 + // 查询格式: /studies?query.term=KEYWORD&pageSize=N + String response = webClient.get() + .uri(uriBuilder -> uriBuilder + .path("/studies") + .queryParam("query.term", keyword) + .queryParam("pageSize", finalPageSize) + .queryParam("format", "json") + .build()) + .retrieve() + .bodyToMono(String.class) + .block(); + + // 解析响应 + return parseApiResponse(response, keyword); + + } catch (Exception e) { + log.error("Error searching clinical trials: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to search clinical trials: " + e.getMessage()); + } + } + + @Override + @Transactional + public List searchAndSaveForInquiry(Long inquiryId, String keyword) { + log.info("Searching and saving clinical trials for inquiry: {}, keyword: {}", inquiryId, keyword); + + // 先删除该查询请求的旧数据 + clinicalTrialRepository.deleteByInquiryId(inquiryId); + + // 搜索临床试验 + ClinicalTrialsSearchResult searchResult = searchClinicalTrials(keyword, 100); + + // 保存到数据库 + List savedTrials = new ArrayList<>(); + for (ClinicalTrialDTO dto : searchResult.getStudies()) { + ClinicalTrial trial = convertToEntity(dto); + trial.setInquiryId(inquiryId); + savedTrials.add(clinicalTrialRepository.save(trial)); + } + + log.info("Saved {} clinical trials for inquiry: {}", savedTrials.size(), inquiryId); + + return savedTrials.stream() + .map(this::convertToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + public List getClinicalTrialsByInquiry(Long inquiryId) { + List trials = clinicalTrialRepository.findByInquiryId(inquiryId); + return trials.stream() + .map(this::convertToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + public byte[] exportToCsv(Long inquiryId) { + log.info("Exporting clinical trials to CSV for inquiry: {}", inquiryId); + + List trials = clinicalTrialRepository.findByInquiryId(inquiryId); + + try (ByteArrayOutputStream baos = new ByteArrayOutputStream(); + OutputStreamWriter writer = new OutputStreamWriter(baos, StandardCharsets.UTF_8)) { + + // 写入 BOM 以支持 Excel 正确识别 UTF-8 + baos.write(0xEF); + baos.write(0xBB); + baos.write(0xBF); + + // 写入CSV头部 + writer.write("NCT ID,Study Title,Overall Status,Phase,Study Type,Start Date,Completion Date,"); + writer.write("Enrollment,Conditions,Interventions,Sponsor,Brief Summary,URL\n"); + + // 写入数据行 + for (ClinicalTrial trial : trials) { + writer.write(escapeCsv(trial.getNctId()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getStudyTitle()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getOverallStatus()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getPhase()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getStudyType()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getStartDate()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getCompletionDate()) + ","); + writer.write(escapeCsv(String.valueOf(trial.getEnrollment())) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getConditions()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getInterventions()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getSponsor()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getBriefSummary()) + ","); + writer.write(escapeCsv(trial.getUrl()) + "\n"); + } + + writer.flush(); + return baos.toByteArray(); + + } catch (Exception e) { + log.error("Error exporting to CSV: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to export CSV: " + e.getMessage()); + } + } + + @Override + @Transactional + public void deleteClinicalTrials(Long inquiryId) { + log.info("Deleting clinical trials for inquiry: {}", inquiryId); + clinicalTrialRepository.deleteByInquiryId(inquiryId); + } + + /** + * 解析 ClinicalTrials.gov API 响应 + */ + private ClinicalTrialsSearchResult parseApiResponse(String response, String keyword) { + try { + JsonNode root = objectMapper.readTree(response); + + // 获取总数 + Integer totalCount = root.path("totalCount").asInt(0); + + // 解析研究列表 + List studies = new ArrayList<>(); + JsonNode studiesNode = root.path("studies"); + + if (studiesNode.isArray()) { + for (JsonNode studyNode : studiesNode) { + JsonNode protocolSection = studyNode.path("protocolSection"); + ClinicalTrialDTO dto = parseStudy(protocolSection); + if (dto != null) { + studies.add(dto); + } + } + } + + log.info("Parsed {} studies from API response (total count: {})", studies.size(), totalCount); + + return new ClinicalTrialsSearchResult(keyword, totalCount, studies); + + } catch (Exception e) { + log.error("Error parsing API response: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to parse API response: " + e.getMessage()); + } + } + + /** + * 解析单个研究 + */ + private ClinicalTrialDTO parseStudy(JsonNode protocolSection) { + try { + ClinicalTrialDTO dto = new ClinicalTrialDTO(); + + // Identification Module + JsonNode idModule = protocolSection.path("identificationModule"); + dto.setNctId(idModule.path("nctId").asText(null)); + dto.setBriefTitle(idModule.path("briefTitle").asText(null)); + dto.setOfficialTitle(idModule.path("officialTitle").asText(null)); + + // Status Module + JsonNode statusModule = protocolSection.path("statusModule"); + dto.setOverallStatus(statusModule.path("overallStatus").asText(null)); + dto.setStartDate(statusModule.path("startDateStruct").path("date").asText(null)); + dto.setCompletionDate(statusModule.path("completionDateStruct").path("date").asText(null)); + + // Design Module + JsonNode designModule = protocolSection.path("designModule"); + dto.setStudyType(designModule.path("studyType").asText(null)); + JsonNode phasesNode = designModule.path("phases"); + if (phasesNode.isArray() && phasesNode.size() > 0) { + dto.setPhase(phasesNode.get(0).asText(null)); + } + + // Enrollment + JsonNode enrollmentModule = designModule.path("enrollmentInfo"); + dto.setEnrollment(enrollmentModule.path("count").asInt(0)); + + // Conditions + JsonNode conditionsModule = protocolSection.path("conditionsModule"); + dto.setConditions(parseStringArray(conditionsModule.path("conditions"))); + + // Interventions + JsonNode armsModule = protocolSection.path("armsInterventionsModule"); + dto.setInterventions(parseInterventions(armsModule.path("interventions"))); + + // Sponsor + JsonNode sponsorModule = protocolSection.path("sponsorCollaboratorsModule"); + JsonNode leadSponsor = sponsorModule.path("leadSponsor"); + dto.setSponsor(leadSponsor.path("name").asText(null)); + dto.setCollaborators(parseCollaborators(sponsorModule.path("collaborators"))); + + // Description + JsonNode descModule = protocolSection.path("descriptionModule"); + dto.setBriefSummary(descModule.path("briefSummary").asText(null)); + dto.setDetailedDescription(descModule.path("detailedDescription").asText(null)); + + // Outcomes + JsonNode outcomesModule = protocolSection.path("outcomesModule"); + dto.setPrimaryOutcome(parseOutcomes(outcomesModule.path("primaryOutcomes"))); + dto.setSecondaryOutcome(parseOutcomes(outcomesModule.path("secondaryOutcomes"))); + + // Eligibility + JsonNode eligibilityModule = protocolSection.path("eligibilityModule"); + dto.setEligibilityCriteria(eligibilityModule.path("eligibilityCriteria").asText(null)); + + // Locations + JsonNode locationsModule = protocolSection.path("contactsLocationsModule"); + dto.setLocations(parseLocations(locationsModule.path("locations"))); + + // URL + dto.setUrl("https://clinicaltrials.gov/study/" + dto.getNctId()); + + dto.setStudyTitle(dto.getBriefTitle() != null ? dto.getBriefTitle() : dto.getOfficialTitle()); + + return dto; + + } catch (Exception e) { + log.warn("Error parsing study: ", e); + return null; + } + } + + private List parseStringArray(JsonNode node) { + List result = new ArrayList<>(); + if (node.isArray()) { + for (JsonNode item : node) { + result.add(item.asText()); + } + } + return result; + } + + private List parseInterventions(JsonNode node) { + List result = new ArrayList<>(); + if (node.isArray()) { + for (JsonNode item : node) { + String name = item.path("name").asText(null); + String type = item.path("type").asText(null); + if (name != null) { + result.add((type != null ? type + ": " : "") + name); + } + } + } + return result; + } + + private List parseCollaborators(JsonNode node) { + List result = new ArrayList<>(); + if (node.isArray()) { + for (JsonNode item : node) { + String name = item.path("name").asText(null); + if (name != null) { + result.add(name); + } + } + } + return result; + } + + private String parseOutcomes(JsonNode node) { + StringBuilder result = new StringBuilder(); + if (node.isArray()) { + for (JsonNode item : node) { + String measure = item.path("measure").asText(null); + if (measure != null) { + if (result.length() > 0) result.append("; "); + result.append(measure); + } + } + } + return result.length() > 0 ? result.toString() : null; + } + + private List parseLocations(JsonNode node) { + List result = new ArrayList<>(); + if (node.isArray()) { + for (JsonNode item : node) { + ClinicalTrialDTO.LocationInfo location = new ClinicalTrialDTO.LocationInfo(); + location.setFacility(item.path("facility").asText(null)); + location.setCity(item.path("city").asText(null)); + location.setState(item.path("state").asText(null)); + location.setCountry(item.path("country").asText(null)); + location.setStatus(item.path("status").asText(null)); + result.add(location); + } + } + return result; + } + + /** + * 转换 DTO 到实体 + */ + private ClinicalTrial convertToEntity(ClinicalTrialDTO dto) { + ClinicalTrial entity = new ClinicalTrial(); + entity.setNctId(dto.getNctId()); + entity.setStudyTitle(dto.getStudyTitle()); + entity.setBriefTitle(dto.getBriefTitle()); + entity.setOfficialTitle(dto.getOfficialTitle()); + entity.setOverallStatus(dto.getOverallStatus()); + entity.setStartDate(dto.getStartDate()); + entity.setCompletionDate(dto.getCompletionDate()); + entity.setStudyType(dto.getStudyType()); + entity.setPhase(dto.getPhase()); + entity.setEnrollment(dto.getEnrollment()); + entity.setSponsor(dto.getSponsor()); + entity.setBriefSummary(dto.getBriefSummary()); + entity.setDetailedDescription(dto.getDetailedDescription()); + entity.setPrimaryOutcome(dto.getPrimaryOutcome()); + entity.setSecondaryOutcome(dto.getSecondaryOutcome()); + entity.setEligibilityCriteria(dto.getEligibilityCriteria()); + entity.setUrl(dto.getUrl()); + + // 转换列表为 JSON + try { + if (dto.getConditions() != null) { + entity.setConditions(objectMapper.writeValueAsString(dto.getConditions())); + } + if (dto.getInterventions() != null) { + entity.setInterventions(objectMapper.writeValueAsString(dto.getInterventions())); + } + if (dto.getCollaborators() != null) { + entity.setCollaborators(objectMapper.writeValueAsString(dto.getCollaborators())); + } + if (dto.getLocations() != null) { + entity.setLocations(objectMapper.writeValueAsString(dto.getLocations())); + } + } catch (Exception e) { + log.error("Error converting lists to JSON: ", e); + } + + return entity; + } + + /** + * 转换实体到 DTO + */ + private ClinicalTrialDTO convertToDTO(ClinicalTrial entity) { + ClinicalTrialDTO dto = new ClinicalTrialDTO(); + dto.setId(entity.getId()); + dto.setInquiryId(entity.getInquiryId()); + dto.setNctId(entity.getNctId()); + dto.setStudyTitle(entity.getStudyTitle()); + dto.setBriefTitle(entity.getBriefTitle()); + dto.setOfficialTitle(entity.getOfficialTitle()); + dto.setOverallStatus(entity.getOverallStatus()); + dto.setStartDate(entity.getStartDate()); + dto.setCompletionDate(entity.getCompletionDate()); + dto.setStudyType(entity.getStudyType()); + dto.setPhase(entity.getPhase()); + dto.setEnrollment(entity.getEnrollment()); + dto.setSponsor(entity.getSponsor()); + dto.setBriefSummary(entity.getBriefSummary()); + dto.setDetailedDescription(entity.getDetailedDescription()); + dto.setPrimaryOutcome(entity.getPrimaryOutcome()); + dto.setSecondaryOutcome(entity.getSecondaryOutcome()); + dto.setEligibilityCriteria(entity.getEligibilityCriteria()); + dto.setUrl(entity.getUrl()); + dto.setCreatedAt(entity.getCreatedAt()); + + // 解析 JSON 为列表 + try { + if (entity.getConditions() != null) { + dto.setConditions(objectMapper.readValue(entity.getConditions(), + objectMapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, String.class))); + } + if (entity.getInterventions() != null) { + dto.setInterventions(objectMapper.readValue(entity.getInterventions(), + objectMapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, String.class))); + } + if (entity.getCollaborators() != null) { + dto.setCollaborators(objectMapper.readValue(entity.getCollaborators(), + objectMapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, String.class))); + } + if (entity.getLocations() != null) { + dto.setLocations(objectMapper.readValue(entity.getLocations(), + objectMapper.getTypeFactory().constructCollectionType(List.class, ClinicalTrialDTO.LocationInfo.class))); + } + } catch (Exception e) { + log.error("Error parsing JSON to lists: ", e); + } + + return dto; + } + + /** + * CSV 字段转义 + */ + private String escapeCsv(String value) { + if (value == null) { + return ""; + } + // 如果包含逗号、引号或换行符，需要用引号包裹并转义引号 + if (value.contains(",") || value.contains("\"") || value.contains("\n")) { + return "\"" + value.replace("\"", "\"\"") + "\""; + } + return value; + } +} + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DifyServiceImpl.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DifyServiceImpl.java index 60dfbff..c652beb 100644 --- a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DifyServiceImpl.java +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DifyServiceImpl.java @@ -1,11 +1,22 @@ package com.ipsen.medical.service.impl; +import com.fasterxml.jackson.databind.JsonNode; +import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper; +import com.ipsen.medical.dto.DifyRequest; +import com.ipsen.medical.dto.DifyResponse; +import com.ipsen.medical.dto.KeywordExtractionResult; import com.ipsen.medical.service.DifyService; import lombok.extern.slf4j.Slf4j; +import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired; import org.springframework.beans.factory.annotation.Value; +import org.springframework.http.HttpHeaders; +import org.springframework.http.MediaType; import org.springframework.stereotype.Service; import org.springframework.web.reactive.function.client.WebClient; +import java.util.HashMap; +import java.util.Map; + /** * Dify AI服务实现 */ @@ -20,61 +31,184 @@ public class DifyServiceImpl implements DifyService { private String difyApiKey; private final WebClient webClient; + private final ObjectMapper objectMapper; - public DifyServiceImpl() { - this.webClient = WebClient.builder().build(); + @Autowired + public DifyServiceImpl(WebClient.Builder webClientBuilder, ObjectMapper objectMapper) { + this.webClient = webClientBuilder + .codecs(configurer -> configurer.defaultCodecs().maxInMemorySize(10 * 1024 * 1024)) + .build(); + this.objectMapper = objectMapper; + } + + @Override + public KeywordExtractionResult extractKeywordsStructured(String content) { + log.info("Extracting keywords structured from content"); + + try { + String response = callDifyAPI(content, "extract_keywords"); + + // 解析响应获取结构化数据 + JsonNode rootNode = objectMapper.readTree(response); + JsonNode answerNode = rootNode.path("answer"); + + String answer; + if (answerNode.isTextual()) { + answer = answerNode.asText(); + } else { + answer = answerNode.toString(); + } + + // 尝试解析answer字段中的JSON + KeywordExtractionResult result; + try { + // 如果answer是JSON格式 + JsonNode resultNode = objectMapper.readTree(answer); + result = new KeywordExtractionResult(); + result.setDrugNameChinese(resultNode.path("drugNameChinese").asText(null)); + result.setDrugNameEnglish(resultNode.path("drugNameEnglish").asText(null)); + result.setRequestItem(resultNode.path("requestItem").asText(null)); + + // 提取置信度 + if (rootNode.has("metadata")) { + JsonNode metadata = rootNode.get("metadata"); + if (metadata.has("confidence")) { + result.setConfidence(metadata.get("confidence").asDouble()); + } + } + } catch (Exception e) { + // 如果answer不是JSON格式，尝试文本解析 + log.warn("Answer is not JSON format, trying text parsing"); + result = parseKeywordsFromText(answer); + } + + log.info("Extracted keywords: Chinese={}, English={}, Item={}", + result.getDrugNameChinese(), result.getDrugNameEnglish(), result.getRequestItem()); + + return result; + + } catch (Exception e) { + log.error("Error extracting keywords: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to extract keywords: " + e.getMessage(), e); + } } @Override public String extractKeywords(String content) { - log.info("Extracting keywords from content"); - - // TODO: 实际实现需要调用Dify API - // 这里提供一个示例实现 - String prompt = "请从以下内容中提取关键词（药物名称、疾病、问题）：\n" + content; - - return callDifyAPI(prompt); + try { + KeywordExtractionResult result = extractKeywordsStructured(content); + return objectMapper.writeValueAsString(result); + } catch (Exception e) { + log.error("Error converting keywords to JSON: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to convert keywords: " + e.getMessage(), e); + } } @Override public String performSearch(String keywords) { log.info("Performing search with keywords: {}", keywords); - // TODO: 实际实现需要调用Dify API进行知识库检索 - String prompt = "根据以下关键词检索相关信息：\n" + keywords; - - return callDifyAPI(prompt); + try { + return callDifyAPI(keywords, "perform_search"); + } catch (Exception e) { + log.error("Error performing search: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to perform search: " + e.getMessage(), e); + } } @Override public String generateResponse(String inquiryContent, String searchResults) { log.info("Generating response"); - // TODO: 实际实现需要调用Dify API生成回复 - String prompt = String.format( - "根据以下查询内容和检索结果，生成专业的回复：\n查询内容：%s\n检索结果：%s", - inquiryContent, searchResults - ); - - return callDifyAPI(prompt); + try { + String combined = String.format( + "查询内容：%s\n\n检索结果：%s", + inquiryContent, searchResults + ); + return callDifyAPI(combined, "generate_response"); + } catch (Exception e) { + log.error("Error generating response: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to generate response: " + e.getMessage(), e); + } } - private String callDifyAPI(String prompt) { + /** + * 调用Dify API + */ + private String callDifyAPI(String content, String taskType) { try { - // TODO: 实际实现Dify API调用 - // 这里提供一个示例返回 - log.info("Calling Dify API with prompt length: {}", prompt.length()); + log.info("Calling Dify API: url={}, taskType={}", difyApiUrl, taskType); - // 示例返回JSON格式 - return "{\"result\": \"示例结果\", \"confidence\": 0.95}"; + // 构建请求 + DifyRequest request = new DifyRequest(); + request.setQuery(content); + request.setResponseMode("blocking"); + request.setUser("medical-info-system"); + + // 添加任务类型到inputs + Map inputs = new HashMap<>(); + inputs.put("task_type", taskType); + inputs.put("content", content); + request.setInputs(inputs); + + // 调用API + String response = webClient.post() + .uri(difyApiUrl + "/chat-messages") + .header(HttpHeaders.AUTHORIZATION, "Bearer " + difyApiKey) + .header(HttpHeaders.CONTENT_TYPE, MediaType.APPLICATION_JSON_VALUE) + .bodyValue(request) + .retrieve() + .bodyToMono(String.class) + .block(); + + log.debug("Dify API response: {}", response); + + return response; } catch (Exception e) { - log.error("Error calling Dify API", e); - throw new RuntimeException("Failed to call Dify API", e); + log.error("Error calling Dify API: ", e); + throw new RuntimeException("Failed to call Dify API: " + e.getMessage(), e); } } + + /** + * 从文本中解析关键词 + */ + private KeywordExtractionResult parseKeywordsFromText(String text) { + KeywordExtractionResult result = new KeywordExtractionResult(); + + // 简单的文本解析逻辑 + String[] lines = text.split("\n"); + for (String line : lines) { + if (line.contains("中文") || line.contains("Chinese")) { + result.setDrugNameChinese(extractValue(line)); + } else if (line.contains("英文") || line.contains("English")) { + result.setDrugNameEnglish(extractValue(line)); + } else if (line.contains("问题") || line.contains("Item") || line.contains("Request")) { + result.setRequestItem(extractValue(line)); + } + } + + return result; + } + + /** + * 从行中提取值 + */ + private String extractValue(String line) { + int colonIndex = line.indexOf(":"); + if (colonIndex != -1 && colonIndex < line.length() - 1) { + return line.substring(colonIndex + 1).trim(); + } + int equalIndex = line.indexOf("="); + if (equalIndex != -1 && equalIndex < line.length() - 1) { + return line.substring(equalIndex + 1).trim(); + } + return line.trim(); + } } + diff --git a/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DrugServiceImpl.java b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DrugServiceImpl.java new file mode 100644 index 0000000..6923381 --- /dev/null +++ b/backend/src/main/java/com/ipsen/medical/service/impl/DrugServiceImpl.java @@ -0,0 +1,262 @@ +package com.ipsen.medical.service.impl; + +import com.ipsen.medical.dto.DrugDTO; +import com.ipsen.medical.dto.DrugSafetyInfoDTO; +import com.ipsen.medical.entity.Drug; +import com.ipsen.medical.entity.DrugSafetyInfo; +import com.ipsen.medical.repository.DrugRepository; +import com.ipsen.medical.repository.DrugSafetyInfoRepository; +import com.ipsen.medical.service.DrugService; +import lombok.RequiredArgsConstructor; +import org.springframework.stereotype.Service; +import org.springframework.transaction.annotation.Transactional; + +import java.time.LocalDateTime; +import java.util.List; +import java.util.stream.Collectors; + +@Service +@RequiredArgsConstructor +public class DrugServiceImpl implements DrugService { + + private final DrugRepository drugRepository; + private final DrugSafetyInfoRepository safetyInfoRepository; + + @Override + public List getAllDrugs() { + return drugRepository.findAll().stream() + .map(this::convertToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + public DrugDTO getDrugById(Long id) { + Drug drug = drugRepository.findById(id) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Drug not found with id: " + id)); + DrugDTO dto = convertToDTO(drug); + dto.setSafetyInfos(getDrugSafetyInfos(id)); + return dto; + } + + @Override + public DrugDTO getDrugByCode(String drugCode) { + Drug drug = drugRepository.findByDrugCode(drugCode) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Drug not found with code: " + drugCode)); + DrugDTO dto = convertToDTO(drug); + dto.setSafetyInfos(getDrugSafetyInfos(drug.getId())); + return dto; + } + + @Override + public List searchDrugs(String keyword) { + return drugRepository.searchDrugs(keyword).stream() + .map(this::convertToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + @Transactional + public DrugDTO createDrug(DrugDTO drugDTO) { + Drug drug = convertToEntity(drugDTO); + drug = drugRepository.save(drug); + return convertToDTO(drug); + } + + @Override + @Transactional + public DrugDTO updateDrug(Long id, DrugDTO drugDTO) { + Drug drug = drugRepository.findById(id) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Drug not found with id: " + id)); + + updateDrugFromDTO(drug, drugDTO); + drug = drugRepository.save(drug); + return convertToDTO(drug); + } + + @Override + @Transactional + public void deleteDrug(Long id) { + drugRepository.deleteById(id); + } + + @Override + public List getDrugSafetyInfos(Long drugId) { + return safetyInfoRepository.findByDrugId(drugId).stream() + .map(this::convertSafetyInfoToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + public List getDrugSafetyInfosBySource(Long drugId, String source) { + DrugSafetyInfo.InfoSource infoSource = DrugSafetyInfo.InfoSource.valueOf(source); + return safetyInfoRepository.findByDrugIdAndSource(drugId, infoSource).stream() + .map(this::convertSafetyInfoToDTO) + .collect(Collectors.toList()); + } + + @Override + @Transactional + public DrugSafetyInfoDTO addSafetyInfo(Long drugId, DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO) { + Drug drug = drugRepository.findById(drugId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Drug not found with id: " + drugId)); + + DrugSafetyInfo safetyInfo = convertSafetyInfoToEntity(safetyInfoDTO); + safetyInfo.setDrug(drug); + safetyInfo = safetyInfoRepository.save(safetyInfo); + + return convertSafetyInfoToDTO(safetyInfo); + } + + @Override + @Transactional + public DrugSafetyInfoDTO updateSafetyInfo(Long safetyInfoId, DrugSafetyInfoDTO safetyInfoDTO) { + DrugSafetyInfo safetyInfo = safetyInfoRepository.findById(safetyInfoId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Safety info not found with id: " + safetyInfoId)); + + updateSafetyInfoFromDTO(safetyInfo, safetyInfoDTO); + safetyInfo = safetyInfoRepository.save(safetyInfo); + + return convertSafetyInfoToDTO(safetyInfo); + } + + @Override + @Transactional + public void deleteSafetyInfo(Long safetyInfoId) { + safetyInfoRepository.deleteById(safetyInfoId); + } + + @Override + @Transactional + public DrugSafetyInfoDTO verifySafetyInfo(Long safetyInfoId, String verifiedBy) { + DrugSafetyInfo safetyInfo = safetyInfoRepository.findById(safetyInfoId) + .orElseThrow(() -> new RuntimeException("Safety info not found with id: " + safetyInfoId)); + + safetyInfo.setVerified(true); + safetyInfo.setVerifiedBy(verifiedBy); + safetyInfo.setVerifiedAt(LocalDateTime.now()); + safetyInfo = safetyInfoRepository.save(safetyInfo); + + return convertSafetyInfoToDTO(safetyInfo); + } + + // Conversion methods + private DrugDTO convertToDTO(Drug drug) { + DrugDTO dto = new DrugDTO(); + dto.setId(drug.getId()); + dto.setDrugCode(drug.getDrugCode()); + dto.setGenericName(drug.getGenericName()); + dto.setTradeName(drug.getTradeName()); + dto.setActiveIngredient(drug.getActiveIngredient()); + dto.setDescription(drug.getDescription()); + dto.setManufacturer(drug.getManufacturer()); + dto.setApprovalNumber(drug.getApprovalNumber()); + dto.setIndications(drug.getIndications()); + dto.setDosageAndAdministration(drug.getDosageAndAdministration()); + dto.setContraindications(drug.getContraindications()); + dto.setTherapeuticClass(drug.getTherapeuticClass()); + dto.setAtcCode(drug.getAtcCode()); + dto.setStatus(drug.getStatus() != null ? drug.getStatus().name() : null); + dto.setCreatedAt(drug.getCreatedAt()); + dto.setUpdatedAt(drug.getUpdatedAt()); + return dto; + } + + private Drug convertToEntity(DrugDTO dto) { + Drug drug = new Drug(); + drug.setDrugCode(dto.getDrugCode()); + drug.setGenericName(dto.getGenericName()); + drug.setTradeName(dto.getTradeName()); + drug.setActiveIngredient(dto.getActiveIngredient()); + drug.setDescription(dto.getDescription()); + drug.setManufacturer(dto.getManufacturer()); + drug.setApprovalNumber(dto.getApprovalNumber()); + drug.setIndications(dto.getIndications()); + drug.setDosageAndAdministration(dto.getDosageAndAdministration()); + drug.setContraindications(dto.getContraindications()); + drug.setTherapeuticClass(dto.getTherapeuticClass()); + drug.setAtcCode(dto.getAtcCode()); + if (dto.getStatus() != null) { + drug.setStatus(Drug.DrugStatus.valueOf(dto.getStatus())); + } + return drug; + } + + private void updateDrugFromDTO(Drug drug, DrugDTO dto) { + if (dto.getGenericName() != null) drug.setGenericName(dto.getGenericName()); + if (dto.getTradeName() != null) drug.setTradeName(dto.getTradeName()); + if (dto.getActiveIngredient() != null) drug.setActiveIngredient(dto.getActiveIngredient()); + if (dto.getDescription() != null) drug.setDescription(dto.getDescription()); + if (dto.getManufacturer() != null) drug.setManufacturer(dto.getManufacturer()); + if (dto.getApprovalNumber() != null) drug.setApprovalNumber(dto.getApprovalNumber()); + if (dto.getIndications() != null) drug.setIndications(dto.getIndications()); + if (dto.getDosageAndAdministration() != null) drug.setDosageAndAdministration(dto.getDosageAndAdministration()); + if (dto.getContraindications() != null) drug.setContraindications(dto.getContraindications()); + if (dto.getTherapeuticClass() != null) drug.setTherapeuticClass(dto.getTherapeuticClass()); + if (dto.getAtcCode() != null) drug.setAtcCode(dto.getAtcCode()); + if (dto.getStatus() != null) drug.setStatus(Drug.DrugStatus.valueOf(dto.getStatus())); + } + + private DrugSafetyInfoDTO convertSafetyInfoToDTO(DrugSafetyInfo safetyInfo) { + DrugSafetyInfoDTO dto = new DrugSafetyInfoDTO(); + dto.setId(safetyInfo.getId()); + dto.setDrugId(safetyInfo.getDrug().getId()); + dto.setSource(safetyInfo.getSource() != null ? safetyInfo.getSource().name() : null); + dto.setTitle(safetyInfo.getTitle()); + dto.setContent(safetyInfo.getContent()); + dto.setCategory(safetyInfo.getCategory() != null ? safetyInfo.getCategory().name() : null); + dto.setSeverityLevel(safetyInfo.getSeverityLevel() != null ? safetyInfo.getSeverityLevel().name() : null); + dto.setReferenceUrl(safetyInfo.getReferenceUrl()); + dto.setReferenceDocument(safetyInfo.getReferenceDocument()); + dto.setReportedBy(safetyInfo.getReportedBy()); + dto.setReportedAt(safetyInfo.getReportedAt()); + dto.setAdditionalInfo(safetyInfo.getAdditionalInfo()); + dto.setVerified(safetyInfo.getVerified()); + dto.setVerifiedBy(safetyInfo.getVerifiedBy()); + dto.setVerifiedAt(safetyInfo.getVerifiedAt()); + dto.setCreatedAt(safetyInfo.getCreatedAt()); + dto.setUpdatedAt(safetyInfo.getUpdatedAt()); + return dto; + } + + private DrugSafetyInfo convertSafetyInfoToEntity(DrugSafetyInfoDTO dto) { + DrugSafetyInfo safetyInfo = new DrugSafetyInfo(); + if (dto.getSource() != null) { + safetyInfo.setSource(DrugSafetyInfo.InfoSource.valueOf(dto.getSource())); + } + safetyInfo.setTitle(dto.getTitle()); + safetyInfo.setContent(dto.getContent()); + if (dto.getCategory() != null) { + safetyInfo.setCategory(DrugSafetyInfo.SafetyCategory.valueOf(dto.getCategory())); + } + if (dto.getSeverityLevel() != null) { + safetyInfo.setSeverityLevel(DrugSafetyInfo.SeverityLevel.valueOf(dto.getSeverityLevel())); + } + safetyInfo.setReferenceUrl(dto.getReferenceUrl()); + safetyInfo.setReferenceDocument(dto.getReferenceDocument()); + safetyInfo.setReportedBy(dto.getReportedBy()); + safetyInfo.setReportedAt(dto.getReportedAt()); + safetyInfo.setAdditionalInfo(dto.getAdditionalInfo()); + return safetyInfo; + } + + private void updateSafetyInfoFromDTO(DrugSafetyInfo safetyInfo, DrugSafetyInfoDTO dto) { + if (dto.getSource() != null) { + safetyInfo.setSource(DrugSafetyInfo.InfoSource.valueOf(dto.getSource())); + } + if (dto.getTitle() != null) safetyInfo.setTitle(dto.getTitle()); + if (dto.getContent() != null) safetyInfo.setContent(dto.getContent()); + if (dto.getCategory() != null) { + safetyInfo.setCategory(DrugSafetyInfo.SafetyCategory.valueOf(dto.getCategory())); + } + if (dto.getSeverityLevel() != null) { + safetyInfo.setSeverityLevel(DrugSafetyInfo.SeverityLevel.valueOf(dto.getSeverityLevel())); + } + if (dto.getReferenceUrl() != null) safetyInfo.setReferenceUrl(dto.getReferenceUrl()); + if (dto.getReferenceDocument() != null) safetyInfo.setReferenceDocument(dto.getReferenceDocument()); + if (dto.getReportedBy() != null) safetyInfo.setReportedBy(dto.getReportedBy()); + if (dto.getReportedAt() != null) safetyInfo.setReportedAt(dto.getReportedAt()); + if (dto.getAdditionalInfo() != null) safetyInfo.setAdditionalInfo(dto.getAdditionalInfo()); + } +} + + diff --git a/backend/src/main/resources/application.yml b/backend/src/main/resources/application.yml index 7e00849..9de5c47 100644 --- a/backend/src/main/resources/application.yml +++ b/backend/src/main/resources/application.yml @@ -38,7 +38,7 @@ app: # Dify配置 dify: api-url: ${DIFY_API_URL:https://api.dify.ai/v1} - api-key: ${DIFY_API_KEY:your-dify-api-key} + api-key: ${DIFY_API_KEY:app-croZF0SSV5fiyXbK3neGrOT6} # 大模型配置 llm: diff --git a/database/add_clinical_trials_table.sql b/database/add_clinical_trials_table.sql new file mode 100644 index 0000000..917994d --- /dev/null +++ b/database/add_clinical_trials_table.sql @@ -0,0 +1,57 @@ +-- 添加临床试验表的迁移脚本 +-- 执行此脚本将在现有数据库中添加 clinical_trials 表 + +USE medical_info_system; + +-- 临床试验表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS clinical_trials ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + inquiry_id BIGINT COMMENT '关联的查询请求ID', + nct_id VARCHAR(50) NOT NULL COMMENT 'ClinicalTrials.gov唯一标识', + study_title TEXT COMMENT '研究标题', + brief_title VARCHAR(500) COMMENT '简短标题', + official_title TEXT COMMENT '官方标题', + overall_status VARCHAR(50) COMMENT '研究状态', + start_date VARCHAR(50) COMMENT '开始日期', + completion_date VARCHAR(50) COMMENT '完成日期', + study_type VARCHAR(50) COMMENT '研究类型', + phase VARCHAR(50) COMMENT '研究阶段', + enrollment INT COMMENT '入组人数', + conditions TEXT COMMENT '适应症（JSON数组）', + interventions TEXT COMMENT '干预措施（JSON数组）', + sponsor VARCHAR(500) COMMENT '主要研究者/机构', + collaborators TEXT COMMENT '合作者（JSON数组）', + locations TEXT COMMENT '研究地点（JSON数组）', + brief_summary TEXT COMMENT '简要摘要', + detailed_description LONGTEXT COMMENT '详细描述', + primary_outcome TEXT COMMENT '主要终点', + secondary_outcome TEXT COMMENT '次要终点', + eligibility_criteria TEXT COMMENT '入选标准', + url VARCHAR(500) COMMENT 'ClinicalTrials.gov链接', + raw_data LONGTEXT COMMENT '原始API返回数据（JSON格式）', + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_inquiry_id (inquiry_id), + INDEX idx_nct_id (nct_id), + INDEX idx_overall_status (overall_status), + INDEX idx_phase (phase), + INDEX idx_created_at (created_at), + UNIQUE KEY uk_inquiry_nct (inquiry_id, nct_id), + FOREIGN KEY (inquiry_id) REFERENCES inquiry_requests(id) ON DELETE CASCADE +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + +-- 验证表是否创建成功 +SELECT + TABLE_NAME, + TABLE_ROWS, + CREATE_TIME +FROM + information_schema.TABLES +WHERE + TABLE_SCHEMA = 'medical_info_system' + AND TABLE_NAME = 'clinical_trials'; + +-- 显示表结构 +DESCRIBE clinical_trials; + + diff --git a/database/drug_sample_data.sql b/database/drug_sample_data.sql new file mode 100644 index 0000000..976c48f --- /dev/null +++ b/database/drug_sample_data.sql @@ -0,0 +1,149 @@ +-- 药物示例数据 - 达菲林 (Diphereline) +-- Database: medical_info_system + +USE medical_info_system; + +-- 插入达菲林药物基本信息 +INSERT INTO drugs (drug_code, generic_name, trade_name, active_ingredient, description, + manufacturer, approval_number, indications, dosage_and_administration, + contraindications, therapeutic_class, atc_code, status, created_at) +VALUES ( + 'DAFE001', + '注射用醋酸曲普瑞林', + '达菲林', + '醋酸曲普瑞林 (Triptorelin Acetate)', + '达菲林是一种促性腺激素释放激素（GnRH）激动剂，通过持续刺激垂体，导致性激素的初期升高，随后因受体下调而抑制性激素的分泌。', + '益普生制药（Ipsen Pharma）', + '国药准字H20140108', + '1. 前列腺癌（转移性或局部晚期）；2. 子宫内膜异位症；3. 子宫肌瘤；4. 中枢性性早熟（儿童）；5. 辅助生殖技术中的降调节', + '成人：肌肉注射或皮下注射，3.75mg，每4周一次；或11.25mg，每12周一次。儿童性早熟：根据体重调整剂量，通常3.75mg，每4周一次。', + '1. 对曲普瑞林或其他GnRH类似物过敏者；2. 妊娠期和哺乳期妇女（除非用于辅助生殖）；3. 骨质疏松症患者需谨慎使用', + '抗肿瘤和内分泌治疗药物', + 'L02AE04', + 'ACTIVE', + NOW() +) +ON DUPLICATE KEY UPDATE drug_code=drug_code; + +-- 获取刚插入的药物ID（用于后续插入安全信息） +SET @drug_id = LAST_INSERT_ID(); + +-- 插入内部数据（INTERNAL） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'INTERNAL', '达菲林临床应用安全性总结', + '根据公司内部研究数据，达菲林在治疗前列腺癌和子宫内膜异位症方面显示出良好的疗效和安全性。长期使用需要监测骨密度变化。建议患者在使用前进行全面的骨质疏松风险评估。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', '益普生医学部', '2024-01-15 10:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '儿童性早熟治疗经验', + '在儿童性早熟治疗中，达菲林显示出良好的疗效。需要密切监测身高、骨龄、第二性征发育情况。治疗期间应每3-6个月评估一次治疗效果。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', '益普生儿科专家组', '2024-02-20 14:30:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '常见不良反应及处理', + '最常见的不良反应包括：潮热（40-60%）、头痛（15-20%）、情绪波动（10-15%）、注射部位反应（5-10%）。大多数不良反应为轻到中度，可自行缓解。对于严重潮热，可考虑短期使用激素替代治疗。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', '药物警戒部', '2024-03-10 09:15:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入文献数据（LITERATURE） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'LITERATURE', '曲普瑞林治疗前列腺癌的长期随访研究', + '一项为期10年的随访研究显示，曲普瑞林在前列腺癌治疗中具有良好的长期安全性。主要不良反应包括骨质疏松（30%）、心血管事件（5-8%）和代谢综合征（10-15%）。建议定期监测骨密度、血脂和血糖水平。', + 'LONG_TERM_EFFECT', 'MODERATE', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example1', '2023-06-15 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', '子宫内膜异位症患者使用GnRH激动剂的安全性评估', + '系统综述分析了15项临床试验共2,500例患者的数据。曲普瑞林治疗子宫内膜异位症有效且安全。最常见不良反应为低雌激素症状（潮热、阴道干燥、性欲减退）。建议治疗期限不超过6个月，或联合小剂量雌激素-孕激素回补治疗。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example2', '2023-09-20 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', 'GnRH激动剂导致的症状加重现象', + '治疗初期（首次注射后1-2周）可能出现"症状加重"（tumor flare），表现为骨痛加剧、排尿困难恶化等。这是由于初期性激素水平升高所致。前列腺癌患者建议在开始治疗时联合使用抗雄激素药物，以预防症状加重。', + 'WARNING', 'SEVERE', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example3', '2023-11-05 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', '儿童性早熟患者身高增长研究', + '多中心研究表明，及时使用曲普瑞林治疗中枢性性早熟可以改善最终成年身高。平均身高增加4-7cm。治疗期间需要监测生长速度、骨龄进展和青春期发育情况。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example4', '2024-01-10 00:00:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入监管公开信息（REGULATORY） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reference_document, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'REGULATORY', '国家药监局：GnRH激动剂类药物安全性信息通报', + '国家药品监督管理局发布安全性信息通报，提醒医疗机构和患者关注GnRH激动剂类药物的以下风险：1. 骨质疏松和骨折风险；2. 心血管风险（包括心肌梗死、脑卒中）；3. 糖尿病和代谢综合征风险；4. 情绪障碍和抑郁风险。建议在使用前进行风险评估，治疗期间密切监测。', + 'WARNING', 'MODERATE', 'https://www.nmpa.gov.cn/example1', 'NMPA-2023-0156', '2023-08-15 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', '药品说明书修订通知 - 增加骨质疏松警示', + '根据国家药监局要求，达菲林说明书已更新，在【注意事项】中增加骨质疏松相关警示：长期使用GnRH激动剂会导致骨密度下降。治疗前应评估骨质疏松风险因素，治疗期间建议补充钙剂和维生素D，必要时进行骨密度检查。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', 'https://www.nmpa.gov.cn/example2', 'NMPA-2024-0023', '2024-02-01 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', 'FDA：曲普瑞林的心血管风险评估', + 'FDA药物安全通讯指出，GnRH激动剂类药物可能增加心血管疾病风险，特别是在已有心血管疾病或危险因素的患者中。建议在开始治疗前评估心血管风险，治疗期间监测血压、血脂和血糖。对于高风险患者，需要权衡获益与风险。', + 'WARNING', 'SEVERE', 'https://www.fda.gov/example1', 'FDA-2023-D-4567', '2023-10-20 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', 'EMA：儿童性早熟治疗建议更新', + '欧洲药品管理局发布儿童性早熟治疗指南更新。强调应严格掌握适应症，仅用于真性性早熟。治疗期间需要定期监测：身高和体重、骨龄、性腺激素水平、第二性征发育情况。建议由儿科内分泌专家进行治疗和随访。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MODERATE', 'https://www.ema.europa.eu/example1', 'EMA-2024-0089', '2024-03-15 00:00:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入自媒体信息（SOCIAL_MEDIA） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '患者分享：达菲林治疗子宫内膜异位症的体验', + '多位患者在健康论坛分享使用达菲林治疗子宫内膜异位症的经历。常见反馈：疼痛症状明显改善（80%以上患者），但潮热、出汗等不适较为普遍（约60%）。部分患者报告情绪波动、失眠等症状。大多数患者表示症状可以耐受，停药后逐渐恢复正常。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', '患者论坛收集', '2024-01-20 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '家长分享：孩子使用达菲林治疗性早熟的经验', + '家长群体反馈，儿童使用达菲林治疗性早熟效果良好，第二性征发育得到有效控制。主要关注点包括：注射疼痛（可以通过正确的注射技术缓解）、治疗费用、是否影响最终身高等。医生建议按时注射、定期随访非常重要。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', '患儿家长群', '2024-02-10 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '患者报告：治疗初期症状加重的担忧', + '部分前列腺癌患者在社交媒体上分享，开始使用达菲林后1-2周内出现骨痛加剧、排尿更困难等情况，引起担忧。医学专家回应这是正常的"症状加重"现象，是药物起效的表现，通常2-4周后会缓解。强调需要在医生指导下使用，必要时联合其他药物预防。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MODERATE', '医疗社交平台', '2024-03-01 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '长期使用者分享：骨质健康管理经验', + '长期使用达菲林的患者分享骨质健康管理经验：坚持补充钙剂和维生素D、进行适量的负重运动（如快走、慢跑）、定期检查骨密度。部分患者在医生建议下使用双膦酸盐类药物预防骨质疏松。强调与医生保持良好沟通、定期复查的重要性。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', '患者互助社区', '2024-03-25 00:00:00', FALSE, NOW()); + +-- 插入临床试验数据（CLINICAL_TRIAL） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '达菲林治疗前列腺癌III期临床试验安全性结果', + '多中心随机对照III期临床试验，纳入560例局部晚期或转移性前列腺癌患者。安全性分析显示：最常见不良反应为潮热（56.7%）、注射部位反应（12.3%）、疲劳（18.9%）、骨痛（15.4%）。严重不良事件发生率为8.2%，主要为骨折（2.1%）和心血管事件（3.5%）。总体安全性良好，与既往研究一致。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MODERATE', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000001', '2023-07-30 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '子宫内膜异位症治疗的安全性和有效性研究', + 'II期临床试验评估达菲林治疗中重度子宫内膜异位症的安全性。120例患者接受6个月治疗。安全性结果：潮热（65%）、头痛（25%）、情绪改变（18%）、阴道干燥（22%）。骨密度平均下降3.5%，停药后6-12个月内大部分恢复。未发现严重安全性问题。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000002', '2023-11-18 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '儿童中枢性性早熟长期治疗随访研究', + '前瞻性队列研究，纳入180例中枢性性早熟患儿，接受达菲林治疗平均2.5年。安全性监测显示：生长速度下降（预期效果）、体重增加（35%）、注射部位无菌性脓肿（3例，1.7%）。未发现严重不良反应。骨密度、代谢指标均在正常范围。最终身高较预测身高平均增加5.2cm。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000003', '2024-02-28 00:00:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入药物相互作用信息 +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'INTERNAL', '达菲林的药物相互作用', + '达菲林与其他药物的相互作用较少。需注意：1. 与抗雄激素药物联用：前列腺癌治疗初期联合使用，可预防症状加重；2. 与激素替代治疗联用：子宫内膜异位症患者可以考虑"回补"治疗，减轻低雌激素症状；3. 与影响垂体功能的药物：可能影响疗效，需谨慎评估。', + 'DRUG_INTERACTION', 'MODERATE', '药学部', '2024-03-20 10:30:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入特殊人群用药信息 +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'INTERNAL', '妊娠期和哺乳期用药', + '禁止在妊娠期使用达菲林（用于辅助生殖除外）。动物研究显示对胎儿有不良影响。哺乳期妇女应停止哺乳。育龄期妇女在治疗期间应采取有效的非激素避孕措施。', + 'PREGNANCY_LACTATION', 'CRITICAL', '妇产科专家组', '2024-01-05 14:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '老年患者用药注意事项', + '老年前列腺癌患者使用达菲林需特别注意：1. 骨质疏松风险更高，建议治疗前评估骨密度；2. 心血管疾病风险增加，需要监测血压、血脂；3. 代谢功能下降，注意血糖监测；4. 认知功能评估，警惕情绪和认知变化。剂量不需调整，但需加强监测。', + 'GERIATRIC_USE', 'MODERATE', '老年医学科', '2024-02-15 09:45:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', '肝肾功能不全患者用药', + '轻至中度肝肾功能不全患者无需调整剂量。严重肝肾功能不全患者使用经验有限，应谨慎使用并密切监测。目前尚无充分的药代动力学数据支持在严重肝肾功能不全患者中的使用。', + 'HEPATIC_IMPAIRMENT', 'MODERATE', '临床药理科', '2024-03-10 11:20:00', TRUE, NOW()); + +COMMIT; + + diff --git a/database/fix_clinical_trials_unique_constraint.sql b/database/fix_clinical_trials_unique_constraint.sql new file mode 100644 index 0000000..d7186ea --- /dev/null +++ b/database/fix_clinical_trials_unique_constraint.sql @@ -0,0 +1,17 @@ +-- 修复临床试验表的唯一约束 +-- 将 nct_id 的全局唯一约束改为 (inquiry_id, nct_id) 的组合唯一约束 +-- 这样允许不同的查询请求可以包含相同的临床试验 + +USE medical_info_system; + +-- 删除现有的 nct_id 唯一索引（如果存在） +-- 注意：可能需要先检查索引名称 +ALTER TABLE clinical_trials DROP INDEX nct_id; + +-- 添加新的组合唯一约束 +ALTER TABLE clinical_trials ADD UNIQUE KEY uk_inquiry_nct (inquiry_id, nct_id); + +-- 验证修改 +SHOW INDEX FROM clinical_trials; + + diff --git a/database/init_drug_module.sql b/database/init_drug_module.sql new file mode 100644 index 0000000..84d5118 --- /dev/null +++ b/database/init_drug_module.sql @@ -0,0 +1,215 @@ +-- 药物模块一键初始化脚本 +-- 包含表结构创建和达菲林示例数据 +-- Database: medical_info_system + +USE medical_info_system; + +-- ============================================ +-- 第一部分：创建表结构 +-- ============================================ + +-- 药物表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS drugs ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + drug_code VARCHAR(50) NOT NULL UNIQUE, + generic_name VARCHAR(200) NOT NULL, + trade_name VARCHAR(200), + active_ingredient VARCHAR(200), + description TEXT, + manufacturer VARCHAR(200), + approval_number VARCHAR(100), + indications TEXT, + dosage_and_administration TEXT, + contraindications TEXT, + therapeutic_class VARCHAR(100), + atc_code VARCHAR(20), + status VARCHAR(20) NOT NULL DEFAULT 'ACTIVE' COMMENT 'ACTIVE, SUSPENDED, WITHDRAWN', + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_drug_code (drug_code), + INDEX idx_generic_name (generic_name), + INDEX idx_trade_name (trade_name), + INDEX idx_therapeutic_class (therapeutic_class), + INDEX idx_status (status) +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + +-- 药物安全信息表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS drug_safety_infos ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + drug_id BIGINT NOT NULL, + source VARCHAR(30) NOT NULL COMMENT 'INTERNAL, LITERATURE, REGULATORY, SOCIAL_MEDIA, CLINICAL_TRIAL', + title VARCHAR(500) NOT NULL, + content TEXT, + category VARCHAR(50) NOT NULL COMMENT 'ADVERSE_REACTION, DRUG_INTERACTION, CONTRAINDICATION, etc.', + severity_level VARCHAR(20) COMMENT 'MILD, MODERATE, SEVERE, CRITICAL', + reference_url VARCHAR(500), + reference_document VARCHAR(500), + reported_by VARCHAR(100), + reported_at DATETIME, + additional_info TEXT COMMENT 'JSON格式的附加信息', + verified BOOLEAN DEFAULT FALSE, + verified_by VARCHAR(100), + verified_at DATETIME, + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_drug_id (drug_id), + INDEX idx_source (source), + INDEX idx_category (category), + INDEX idx_severity_level (severity_level), + INDEX idx_verified (verified), + FOREIGN KEY (drug_id) REFERENCES drugs(id) ON DELETE CASCADE +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + +-- ============================================ +-- 第二部分：插入达菲林示例数据 +-- ============================================ + +-- 插入达菲林药物基本信息 +INSERT INTO drugs (drug_code, generic_name, trade_name, active_ingredient, description, + manufacturer, approval_number, indications, dosage_and_administration, + contraindications, therapeutic_class, atc_code, status, created_at) +VALUES ( + 'DAFE001', + '注射用醋酸曲普瑞林', + '达菲林', + '醋酸曲普瑞林 (Triptorelin Acetate)', + '达菲林是一种促性腺激素释放激素（GnRH）激动剂，通过持续刺激垂体，导致性激素的初期升高，随后因受体下调而抑制性激素的分泌。', + '益普生制药（Ipsen Pharma）', + '国药准字H20140108', + '1. 前列腺癌（转移性或局部晚期）；2. 子宫内膜异位症；3. 子宫肌瘤；4. 中枢性性早熟（儿童）；5. 辅助生殖技术中的降调节', + '成人：肌肉注射或皮下注射，3.75mg，每4周一次；或11.25mg，每12周一次。儿童性早熟：根据体重调整剂量，通常3.75mg，每4周一次。', + '1. 对曲普瑞林或其他GnRH类似物过敏者；2. 妊娠期和哺乳期妇女（除非用于辅助生殖）；3. 骨质疏松症患者需谨慎使用', + '抗肿瘤和内分泌治疗药物', + 'L02AE04', + 'ACTIVE', + NOW() +) +ON DUPLICATE KEY UPDATE drug_code=drug_code; + +-- 获取刚插入的药物ID +SET @drug_id = (SELECT id FROM drugs WHERE drug_code = 'DAFE001'); + +-- 清除旧的安全信息（如果重复执行） +DELETE FROM drug_safety_infos WHERE drug_id = @drug_id; + +-- 插入内部数据（INTERNAL） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'INTERNAL', '达菲林临床应用安全性总结', + '根据公司内部研究数据，达菲林在治疗前列腺癌和子宫内膜异位症方面显示出良好的疗效和安全性。长期使用需要监测骨密度变化。建议患者在使用前进行全面的骨质疏松风险评估。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', '益普生医学部', '2024-01-15 10:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '儿童性早熟治疗经验', + '在儿童性早熟治疗中，达菲林显示出良好的疗效。需要密切监测身高、骨龄、第二性征发育情况。治疗期间应每3-6个月评估一次治疗效果。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', '益普生儿科专家组', '2024-02-20 14:30:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '常见不良反应及处理', + '最常见的不良反应包括：潮热（40-60%）、头痛（15-20%）、情绪波动（10-15%）、注射部位反应（5-10%）。大多数不良反应为轻到中度，可自行缓解。对于严重潮热，可考虑短期使用激素替代治疗。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', '药物警戒部', '2024-03-10 09:15:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '达菲林的药物相互作用', + '达菲林与其他药物的相互作用较少。需注意：1. 与抗雄激素药物联用：前列腺癌治疗初期联合使用，可预防症状加重；2. 与激素替代治疗联用：子宫内膜异位症患者可以考虑"回补"治疗，减轻低雌激素症状；3. 与影响垂体功能的药物：可能影响疗效，需谨慎评估。', + 'DRUG_INTERACTION', 'MODERATE', '药学部', '2024-03-20 10:30:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '妊娠期和哺乳期用药', + '禁止在妊娠期使用达菲林（用于辅助生殖除外）。动物研究显示对胎儿有不良影响。哺乳期妇女应停止哺乳。育龄期妇女在治疗期间应采取有效的非激素避孕措施。', + 'PREGNANCY_LACTATION', 'CRITICAL', '妇产科专家组', '2024-01-05 14:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'INTERNAL', '老年患者用药注意事项', + '老年前列腺癌患者使用达菲林需特别注意：1. 骨质疏松风险更高，建议治疗前评估骨密度；2. 心血管疾病风险增加，需要监测血压、血脂；3. 代谢功能下降，注意血糖监测；4. 认知功能评估，警惕情绪和认知变化。剂量不需调整，但需加强监测。', + 'GERIATRIC_USE', 'MODERATE', '老年医学科', '2024-02-15 09:45:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入文献数据（LITERATURE） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'LITERATURE', '曲普瑞林治疗前列腺癌的长期随访研究', + '一项为期10年的随访研究显示，曲普瑞林在前列腺癌治疗中具有良好的长期安全性。主要不良反应包括骨质疏松（30%）、心血管事件（5-8%）和代谢综合征（10-15%）。建议定期监测骨密度、血脂和血糖水平。', + 'LONG_TERM_EFFECT', 'MODERATE', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example1', '2023-06-15 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', '子宫内膜异位症患者使用GnRH激动剂的安全性评估', + '系统综述分析了15项临床试验共2,500例患者的数据。曲普瑞林治疗子宫内膜异位症有效且安全。最常见不良反应为低雌激素症状（潮热、阴道干燥、性欲减退）。建议治疗期限不超过6个月，或联合小剂量雌激素-孕激素回补治疗。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example2', '2023-09-20 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', 'GnRH激动剂导致的症状加重现象', + '治疗初期（首次注射后1-2周）可能出现"症状加重"（tumor flare），表现为骨痛加剧、排尿困难恶化等。这是由于初期性激素水平升高所致。前列腺癌患者建议在开始治疗时联合使用抗雄激素药物，以预防症状加重。', + 'WARNING', 'SEVERE', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example3', '2023-11-05 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'LITERATURE', '儿童性早熟患者身高增长研究', + '多中心研究表明，及时使用曲普瑞林治疗中枢性性早熟可以改善最终成年身高。平均身高增加4-7cm。治疗期间需要监测生长速度、骨龄进展和青春期发育情况。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', 'https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/example4', '2024-01-10 00:00:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入监管公开信息（REGULATORY） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reference_document, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'REGULATORY', '国家药监局：GnRH激动剂类药物安全性信息通报', + '国家药品监督管理局发布安全性信息通报，提醒医疗机构和患者关注GnRH激动剂类药物的以下风险：1. 骨质疏松和骨折风险；2. 心血管风险（包括心肌梗死、脑卒中）；3. 糖尿病和代谢综合征风险；4. 情绪障碍和抑郁风险。建议在使用前进行风险评估，治疗期间密切监测。', + 'WARNING', 'MODERATE', 'https://www.nmpa.gov.cn/example1', 'NMPA-2023-0156', '2023-08-15 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', '药品说明书修订通知 - 增加骨质疏松警示', + '根据国家药监局要求，达菲林说明书已更新，在【注意事项】中增加骨质疏松相关警示：长期使用GnRH激动剂会导致骨密度下降。治疗前应评估骨质疏松风险因素，治疗期间建议补充钙剂和维生素D，必要时进行骨密度检查。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', 'https://www.nmpa.gov.cn/example2', 'NMPA-2024-0023', '2024-02-01 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', 'FDA：曲普瑞林的心血管风险评估', + 'FDA药物安全通讯指出，GnRH激动剂类药物可能增加心血管疾病风险，特别是在已有心血管疾病或危险因素的患者中。建议在开始治疗前评估心血管风险，治疗期间监测血压、血脂和血糖。对于高风险患者，需要权衡获益与风险。', + 'WARNING', 'SEVERE', 'https://www.fda.gov/example1', 'FDA-2023-D-4567', '2023-10-20 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', 'EMA：儿童性早熟治疗建议更新', + '欧洲药品管理局发布儿童性早熟治疗指南更新。强调应严格掌握适应症，仅用于真性性早熟。治疗期间需要定期监测：身高和体重、骨龄、性腺激素水平、第二性征发育情况。建议由儿科内分泌专家进行治疗和随访。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MODERATE', 'https://www.ema.europa.eu/example1', 'EMA-2024-0089', '2024-03-15 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'REGULATORY', '肝肾功能不全患者用药', + '轻至中度肝肾功能不全患者无需调整剂量。严重肝肾功能不全患者使用经验有限，应谨慎使用并密切监测。目前尚无充分的药代动力学数据支持在严重肝肾功能不全患者中的使用。', + 'HEPATIC_IMPAIRMENT', 'MODERATE', 'https://www.nmpa.gov.cn/example3', 'NMPA-2024-0045', '2024-03-10 11:20:00', TRUE, NOW()); + +-- 插入自媒体信息（SOCIAL_MEDIA） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reported_by, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '患者分享：达菲林治疗子宫内膜异位症的体验', + '多位患者在健康论坛分享使用达菲林治疗子宫内膜异位症的经历。常见反馈：疼痛症状明显改善（80%以上患者），但潮热、出汗等不适较为普遍（约60%）。部分患者报告情绪波动、失眠等症状。大多数患者表示症状可以耐受，停药后逐渐恢复正常。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', '患者论坛收集', '2024-01-20 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '家长分享：孩子使用达菲林治疗性早熟的经验', + '家长群体反馈，儿童使用达菲林治疗性早熟效果良好，第二性征发育得到有效控制。主要关注点包括：注射疼痛（可以通过正确的注射技术缓解）、治疗费用、是否影响最终身高等。医生建议按时注射、定期随访非常重要。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', '患儿家长群', '2024-02-10 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '患者报告：治疗初期症状加重的担忧', + '部分前列腺癌患者在社交媒体上分享，开始使用达菲林后1-2周内出现骨痛加剧、排尿更困难等情况，引起担忧。医学专家回应这是正常的"症状加重"现象，是药物起效的表现，通常2-4周后会缓解。强调需要在医生指导下使用，必要时联合其他药物预防。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MODERATE', '医疗社交平台', '2024-03-01 00:00:00', FALSE, NOW()), + +(@drug_id, 'SOCIAL_MEDIA', '长期使用者分享：骨质健康管理经验', + '长期使用达菲林的患者分享骨质健康管理经验：坚持补充钙剂和维生素D、进行适量的负重运动（如快走、慢跑）、定期检查骨密度。部分患者在医生建议下使用双膦酸盐类药物预防骨质疏松。强调与医生保持良好沟通、定期复查的重要性。', + 'PRECAUTION', 'MODERATE', '患者互助社区', '2024-03-25 00:00:00', FALSE, NOW()); + +-- 插入临床试验数据（CLINICAL_TRIAL） +INSERT INTO drug_safety_infos (drug_id, source, title, content, category, severity_level, + reference_url, reported_at, verified, created_at) +VALUES +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '达菲林治疗前列腺癌III期临床试验安全性结果', + '多中心随机对照III期临床试验，纳入560例局部晚期或转移性前列腺癌患者。安全性分析显示：最常见不良反应为潮热（56.7%）、注射部位反应（12.3%）、疲劳（18.9%）、骨痛（15.4%）。严重不良事件发生率为8.2%，主要为骨折（2.1%）和心血管事件（3.5%）。总体安全性良好，与既往研究一致。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MODERATE', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000001', '2023-07-30 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '子宫内膜异位症治疗的安全性和有效性研究', + 'II期临床试验评估达菲林治疗中重度子宫内膜异位症的安全性。120例患者接受6个月治疗。安全性结果：潮热（65%）、头痛（25%）、情绪改变（18%）、阴道干燥（22%）。骨密度平均下降3.5%，停药后6-12个月内大部分恢复。未发现严重安全性问题。', + 'ADVERSE_REACTION', 'MILD', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000002', '2023-11-18 00:00:00', TRUE, NOW()), + +(@drug_id, 'CLINICAL_TRIAL', '儿童中枢性性早熟长期治疗随访研究', + '前瞻性队列研究，纳入180例中枢性性早熟患儿，接受达菲林治疗平均2.5年。安全性监测显示：生长速度下降（预期效果）、体重增加（35%）、注射部位无菌性脓肿（3例，1.7%）。未发现严重不良反应。骨密度、代谢指标均在正常范围。最终身高较预测身高平均增加5.2cm。', + 'PEDIATRIC_USE', 'MILD', 'https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00000003', '2024-02-28 00:00:00', TRUE, NOW()); + +COMMIT; + +-- ============================================ +-- 初始化完成提示 +-- ============================================ +SELECT '药物模块初始化完成！' AS message, + (SELECT COUNT(*) FROM drugs WHERE drug_code = 'DAFE001') AS drug_count, + (SELECT COUNT(*) FROM drug_safety_infos WHERE drug_id = @drug_id) AS safety_info_count; + + + + + diff --git a/database/schema.sql b/database/schema.sql index 5cc5fda..013774b 100644 --- a/database/schema.sql +++ b/database/schema.sql @@ -101,6 +101,95 @@ CREATE TABLE IF NOT EXISTS audit_logs ( FOREIGN KEY (user_id) REFERENCES users(id) ON DELETE SET NULL ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; +-- 药物表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS drugs ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + drug_code VARCHAR(50) NOT NULL UNIQUE, + generic_name VARCHAR(200) NOT NULL, + trade_name VARCHAR(200), + active_ingredient VARCHAR(200), + description TEXT, + manufacturer VARCHAR(200), + approval_number VARCHAR(100), + indications TEXT, + dosage_and_administration TEXT, + contraindications TEXT, + therapeutic_class VARCHAR(100), + atc_code VARCHAR(20), + status VARCHAR(20) NOT NULL DEFAULT 'ACTIVE' COMMENT 'ACTIVE, SUSPENDED, WITHDRAWN', + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_drug_code (drug_code), + INDEX idx_generic_name (generic_name), + INDEX idx_trade_name (trade_name), + INDEX idx_therapeutic_class (therapeutic_class), + INDEX idx_status (status) +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + +-- 药物安全信息表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS drug_safety_infos ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + drug_id BIGINT NOT NULL, + source VARCHAR(30) NOT NULL COMMENT 'INTERNAL, LITERATURE, REGULATORY, SOCIAL_MEDIA, CLINICAL_TRIAL', + title VARCHAR(500) NOT NULL, + content TEXT, + category VARCHAR(50) NOT NULL COMMENT 'ADVERSE_REACTION, DRUG_INTERACTION, CONTRAINDICATION, etc.', + severity_level VARCHAR(20) COMMENT 'MILD, MODERATE, SEVERE, CRITICAL', + reference_url VARCHAR(500), + reference_document VARCHAR(500), + reported_by VARCHAR(100), + reported_at DATETIME, + additional_info TEXT COMMENT 'JSON格式的附加信息', + verified BOOLEAN DEFAULT FALSE, + verified_by VARCHAR(100), + verified_at DATETIME, + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_drug_id (drug_id), + INDEX idx_source (source), + INDEX idx_category (category), + INDEX idx_severity_level (severity_level), + INDEX idx_verified (verified), + FOREIGN KEY (drug_id) REFERENCES drugs(id) ON DELETE CASCADE +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + +-- 临床试验表 +CREATE TABLE IF NOT EXISTS clinical_trials ( + id BIGINT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT, + inquiry_id BIGINT COMMENT '关联的查询请求ID', + nct_id VARCHAR(50) NOT NULL COMMENT 'ClinicalTrials.gov唯一标识', + study_title TEXT COMMENT '研究标题', + brief_title VARCHAR(500) COMMENT '简短标题', + official_title TEXT COMMENT '官方标题', + overall_status VARCHAR(50) COMMENT '研究状态', + start_date VARCHAR(50) COMMENT '开始日期', + completion_date VARCHAR(50) COMMENT '完成日期', + study_type VARCHAR(50) COMMENT '研究类型', + phase VARCHAR(50) COMMENT '研究阶段', + enrollment INT COMMENT '入组人数', + conditions TEXT COMMENT '适应症（JSON数组）', + interventions TEXT COMMENT '干预措施（JSON数组）', + sponsor VARCHAR(500) COMMENT '主要研究者/机构', + collaborators TEXT COMMENT '合作者（JSON数组）', + locations TEXT COMMENT '研究地点（JSON数组）', + brief_summary TEXT COMMENT '简要摘要', + detailed_description LONGTEXT COMMENT '详细描述', + primary_outcome TEXT COMMENT '主要终点', + secondary_outcome TEXT COMMENT '次要终点', + eligibility_criteria TEXT COMMENT '入选标准', + url VARCHAR(500) COMMENT 'ClinicalTrials.gov链接', + raw_data LONGTEXT COMMENT '原始API返回数据（JSON格式）', + created_at DATETIME NOT NULL, + updated_at DATETIME, + INDEX idx_inquiry_id (inquiry_id), + INDEX idx_nct_id (nct_id), + INDEX idx_overall_status (overall_status), + INDEX idx_phase (phase), + INDEX idx_created_at (created_at), + UNIQUE KEY uk_inquiry_nct (inquiry_id, nct_id), + FOREIGN KEY (inquiry_id) REFERENCES inquiry_requests(id) ON DELETE CASCADE +) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci; + -- 插入默认管理员用户 (密码: admin123, 实际使用时应该加密) INSERT INTO users (username, password, full_name, email, role, enabled, created_at) VALUES ('admin', '$2a$10$rK8WpQYJzxJ8Y5X5YqFvRO5K7K5K7K5K7K5K7K5K7K5K7K5K7K5K7', diff --git a/docker-compose.yml b/docker-compose.yml index eea7b1a..9eeb4a9 100644 --- a/docker-compose.yml +++ b/docker-compose.yml @@ -1,79 +1,49 @@ -version: '3.8' +# Comments are provided throughout this file to help you get started. +# If you need more help, visit the Docker Compose reference guide at +# https://docs.docker.com/go/compose-spec-reference/ +# Here the instructions define your application as a service called "server". +# This service is built from the Dockerfile in the current directory. +# You can add other services your application may depend on here, such as a +# database or a cache. For examples, see the Awesome Compose repository: +# https://github.com/docker/awesome-compose services: - # MySQL数据库 - mysql: - image: mysql:8.0 - container_name: medical-info-mysql - restart: always - environment: - MYSQL_ROOT_PASSWORD: ${MYSQL_ROOT_PASSWORD:-root123} - MYSQL_DATABASE: medical_info_system - MYSQL_USER: ${MYSQL_USER:-medical_user} - MYSQL_PASSWORD: ${MYSQL_PASSWORD:-medical_pass} - TZ: Asia/Shanghai - ports: - - "3306:3306" - volumes: - - mysql-data:/var/lib/mysql - - ./database/schema.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/1-schema.sql - - ./database/sample_data.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/2-sample_data.sql - command: --default-authentication-plugin=mysql_native_password - networks: - - medical-info-network - - # 后端Spring Boot应用 - backend: + server: build: - context: ./backend - dockerfile: Dockerfile - container_name: medical-info-backend - restart: always - environment: - SPRING_PROFILES_ACTIVE: ${SPRING_PROFILES_ACTIVE:-prod} - DB_HOST: mysql - DB_PORT: 3306 - DB_NAME: medical_info_system - DB_USERNAME: ${MYSQL_USER:-medical_user} - DB_PASSWORD: ${MYSQL_PASSWORD:-medical_pass} - JWT_SECRET: ${JWT_SECRET:-your-secret-key-change-in-production} - DIFY_API_URL: ${DIFY_API_URL:-https://api.dify.ai/v1} - DIFY_API_KEY: ${DIFY_API_KEY} - LLM_API_URL: ${LLM_API_URL:-https://api.openai.com/v1} - LLM_API_KEY: ${LLM_API_KEY} - LLM_MODEL: ${LLM_MODEL:-gpt-4} + context: . ports: - - "8080:8080" - volumes: - - ./downloads:/app/downloads - - ./logs:/app/logs - depends_on: - - mysql - networks: - - medical-info-network - - # 前端Vue3应用 - frontend: - build: - context: ./frontend - dockerfile: Dockerfile - container_name: medical-info-frontend - restart: always - ports: - - "80:80" - depends_on: - - backend - networks: - - medical-info-network - -volumes: - mysql-data: - driver: local - -networks: - medical-info-network: - driver: bridge - - + - 8080:8080 +# The commented out section below is an example of how to define a PostgreSQL +# database that your application can use. `depends_on` tells Docker Compose to +# start the database before your application. The `db-data` volume persists the +# database data between container restarts. The `db-password` secret is used +# to set the database password. You must create `db/password.txt` and add +# a password of your choosing to it before running `docker-compose up`. +# depends_on: +# db: +# condition: service_healthy +# db: +# image: postgres +# restart: always +# user: postgres +# secrets: +# - db-password +# volumes: +# - db-data:/var/lib/postgresql/data +# environment: +# - POSTGRES_DB=example +# - POSTGRES_PASSWORD_FILE=/run/secrets/db-password +# expose: +# - 5432 +# healthcheck: +# test: [ "CMD", "pg_isready" ] +# interval: 10s +# timeout: 5s +# retries: 5 +# volumes: +# db-data: +# secrets: +# db-password: +# file: db/password.txt diff --git a/frontend/src/api/drug.js b/frontend/src/api/drug.js new file mode 100644 index 0000000..ebeab28 --- /dev/null +++ b/frontend/src/api/drug.js @@ -0,0 +1,139 @@ +import request from '@/utils/request' + +/** + * 获取所有药物列表 + */ +export function getAllDrugs() { + return request({ + url: '/drugs', + method: 'get' + }) +} + +/** + * 根据ID获取药物详情（包含所有安全信息） + */ +export function getDrugById(id) { + return request({ + url: `/drugs/${id}`, + method: 'get' + }) +} + +/** + * 根据药物编码获取药物详情 + */ +export function getDrugByCode(drugCode) { + return request({ + url: `/drugs/code/${drugCode}`, + method: 'get' + }) +} + +/** + * 搜索药物 + */ +export function searchDrugs(keyword) { + return request({ + url: '/drugs/search', + method: 'get', + params: { keyword } + }) +} + +/** + * 创建药物 + */ +export function createDrug(data) { + return request({ + url: '/drugs', + method: 'post', + data + }) +} + +/** + * 更新药物 + */ +export function updateDrug(id, data) { + return request({ + url: `/drugs/${id}`, + method: 'put', + data + }) +} + +/** + * 删除药物 + */ +export function deleteDrug(id) { + return request({ + url: `/drugs/${id}`, + method: 'delete' + }) +} + +/** + * 获取药物的所有安全信息 + */ +export function getDrugSafetyInfos(id) { + return request({ + url: `/drugs/${id}/safety-infos`, + method: 'get' + }) +} + +/** + * 根据来源获取安全信息 + */ +export function getDrugSafetyInfosBySource(id, source) { + return request({ + url: `/drugs/${id}/safety-infos/source/${source}`, + method: 'get' + }) +} + +/** + * 添加安全信息 + */ +export function addSafetyInfo(id, data) { + return request({ + url: `/drugs/${id}/safety-infos`, + method: 'post', + data + }) +} + +/** + * 更新安全信息 + */ +export function updateSafetyInfo(safetyInfoId, data) { + return request({ + url: `/drugs/safety-infos/${safetyInfoId}`, + method: 'put', + data + }) +} + +/** + * 删除安全信息 + */ +export function deleteSafetyInfo(safetyInfoId) { + return request({ + url: `/drugs/safety-infos/${safetyInfoId}`, + method: 'delete' + }) +} + +/** + * 验证安全信息 + */ +export function verifySafetyInfo(safetyInfoId, verifiedBy) { + return request({ + url: `/drugs/safety-infos/${safetyInfoId}/verify`, + method: 'post', + params: { verifiedBy } + }) +} + + diff --git a/frontend/src/api/inquiry.js b/frontend/src/api/inquiry.js index d15d984..75053c7 100644 --- a/frontend/src/api/inquiry.js +++ b/frontend/src/api/inquiry.js @@ -99,6 +99,67 @@ export function completeInquiry(id) { }) } +/** + * 搜索临床试验 + */ +export function searchClinicalTrials(id, keyword) { + return request({ + url: `/inquiries/${id}/clinical-trials/search`, + method: 'post', + params: { keyword } + }) +} + +/** + * 获取临床试验列表 + */ +export function getClinicalTrials(id) { + return request({ + url: `/inquiries/${id}/clinical-trials`, + method: 'get' + }) +} + +/** + * 导出临床试验为CSV + */ +export function exportClinicalTrials(id) { + return `/inquiries/${id}/clinical-trials/export` +} + +/** + * 删除临床试验数据 + */ +export function deleteClinicalTrials(id) { + return request({ + url: `/inquiries/${id}/clinical-trials`, + method: 'delete' + }) +} + +/** + * 基于AI识别的关键词执行自动检索 + */ +export function performAutoSearch(id) { + return request({ + url: `/inquiries/${id}/auto-search`, + method: 'post' + }) +} + +/** + * 执行完整的AI工作流 + * 1. 提取关键词 + * 2. 自动检索（临床试验、知识库） + * 3. 生成回复 + */ +export function executeFullWorkflow(id) { + return request({ + url: `/inquiries/${id}/full-workflow`, + method: 'post' + }) +} + diff --git a/frontend/src/router/index.js b/frontend/src/router/index.js index 92f70af..ab8a9c9 100644 --- a/frontend/src/router/index.js +++ b/frontend/src/router/index.js @@ -62,6 +62,27 @@ const routes = [ } ] }, + { + path: '/drug', + component: Layout, + redirect: '/drug/list', + meta: { title: '药物信息', icon: 'Medicine' }, + children: [ + { + path: 'list', + name: 'DrugList', + component: () => import('@/views/drug/DrugList.vue'), + meta: { title: '药物列表', icon: 'List' } + }, + { + path: 'detail/:id', + name: 'DrugDetail', + component: () => import('@/views/drug/DrugDetail.vue'), + meta: { title: '药物详情', icon: 'View' }, + hidden: true + } + ] + }, { path: '/system', component: Layout, diff --git a/frontend/src/views/drug/DrugDetail.vue b/frontend/src/views/drug/DrugDetail.vue new file mode 100644 index 0000000..6317c49 --- /dev/null +++ b/frontend/src/views/drug/DrugDetail.vue @@ -0,0 +1,224 @@ + + + + + + diff --git a/frontend/src/views/drug/DrugList.vue b/frontend/src/views/drug/DrugList.vue new file mode 100644 index 0000000..34848f8 --- /dev/null +++ b/frontend/src/views/drug/DrugList.vue @@ -0,0 +1,190 @@ + + + + + + diff --git a/frontend/src/views/drug/components/SafetyInfoList.vue b/frontend/src/views/drug/components/SafetyInfoList.vue new file mode 100644 index 0000000..34c8f19 --- /dev/null +++ b/frontend/src/views/drug/components/SafetyInfoList.vue @@ -0,0 +1,266 @@ + + + + + + + diff --git a/frontend/src/views/inquiry/InquiryCreate.vue b/frontend/src/views/inquiry/InquiryCreate.vue index 818c59f..47c5d55 100644 --- a/frontend/src/views/inquiry/InquiryCreate.vue +++ b/frontend/src/views/inquiry/InquiryCreate.vue @@ -13,7 +13,7 @@ :auto-upload="false" :on-change="handleFileChange" :limit="1" - accept=".xlsx,.xls" + accept=".xlsx,.xls，.txt，.docx,.doc" >
@@ -21,7 +21,7 @@
diff --git a/frontend/src/views/inquiry/InquiryDetail.vue b/frontend/src/views/inquiry/InquiryDetail.vue index 29c7a4c..78bb792 100644 --- a/frontend/src/views/inquiry/InquiryDetail.vue +++ b/frontend/src/views/inquiry/InquiryDetail.vue @@ -46,6 +46,17 @@
+ + + 一键执行AI流程 + + + + 智能自动检索 + +
-

提取的关键词

- - {{ keyword }} - +

AI识别结果

+
+ + + {{ getKeywordField(inquiry.keywords, 'drugNameChinese') }} + + + {{ getKeywordField(inquiry.keywords, 'drugNameEnglish') }} + + + {{ getKeywordField(inquiry.keywords, 'requestItem') || '未指定' }} + + +
+
+ + {{ keyword }} + +
@@ -130,6 +166,156 @@
+ + + +
+
+

临床试验信息 (ClinicalTrials.gov)

+
+ + + 搜索临床试验 + + + 导出CSV + + + 刷新 + +
+
+ +
+ + + + + + + + + + + + + + + + + +
+ + +
+
返回列表
@@ -146,7 +332,12 @@ import { performSearch, generateResponse, reviewResponse, - completeInquiry + completeInquiry, + searchClinicalTrials, + getClinicalTrials, + exportClinicalTrials, + performAutoSearch, + executeFullWorkflow } from '@/api/inquiry' import { ElMessage, ElMessageBox } from 'element-plus' @@ -156,6 +347,9 @@ const route = useRoute() const loading = ref(false) const processing = ref(false) const inquiry = ref({}) +const clinicalTrials = ref([]) +const clinicalTrialKeyword = ref('') +const searchingClinicalTrials = ref(false) const currentStep = computed(() => { const stepMap = { @@ -172,6 +366,18 @@ const currentStep = computed(() => { onMounted(() => { loadDetail() + loadClinicalTrials() + // 自动填充关键词作为搜索词 + if (inquiry.value.keywords) { + try { + const keywords = JSON.parse(inquiry.value.keywords) + if (Array.isArray(keywords) && keywords.length > 0) { + clinicalTrialKeyword.value = keywords[0] + } + } catch (e) { + // 忽略解析错误 + } + } }) const loadDetail = async () => { @@ -186,6 +392,15 @@ const loadDetail = async () => { } } +const loadClinicalTrials = async () => { + try { + const id = route.params.id + clinicalTrials.value = await getClinicalTrials(id) + } catch (error) { + console.error('加载临床试验数据失败', error) + } +} + const handleExtractKeywords = async () => { processing.value = true try { @@ -321,6 +536,92 @@ const formatJSON = (jsonStr) => { return jsonStr } } + +const handleSearchClinicalTrials = async () => { + if (!clinicalTrialKeyword.value.trim()) { + ElMessage.warning('请输入药品名称') + return + } + + searchingClinicalTrials.value = true + try { + await searchClinicalTrials(inquiry.value.id, clinicalTrialKeyword.value.trim()) + ElMessage.success('临床试验搜索完成') + await loadClinicalTrials() + } catch (error) { + ElMessage.error('搜索失败: ' + (error.message || '未知错误')) + } finally { + searchingClinicalTrials.value = false + } +} + +const handleExportClinicalTrials = () => { + const exportUrl = exportClinicalTrials(inquiry.value.id) + // 使用后端API的完整URL + const baseURL = import.meta.env.VITE_API_BASE_URL || 'http://localhost:8080' + window.open(baseURL + exportUrl, '_blank') + ElMessage.success('开始下载CSV文件') +} + +const getStatusTagType = (status) => { + const statusMap = { + 'COMPLETED': 'success', + 'ACTIVE': 'primary', + 'RECRUITING': 'warning', + 'NOT_YET_RECRUITING': 'info', + 'TERMINATED': 'danger', + 'WITHDRAWN': 'danger', + 'SUSPENDED': 'warning', + 'ENROLLING_BY_INVITATION': 'warning' + } + return statusMap[status?.toUpperCase().replace(/ /g, '_')] || 'info' +} + +const handleFullWorkflow = async () => { + processing.value = true + try { + await executeFullWorkflow(inquiry.value.id) + ElMessage.success('AI智能流程执行完成！正在加载结果...') + await loadDetail() + await loadClinicalTrials() + } catch (error) { + ElMessage.error('执行失败: ' + (error.message || '未知错误')) + } finally { + processing.value = false + } +} + +const handleAutoSearch = async () => { + processing.value = true + try { + await performAutoSearch(inquiry.value.id) + ElMessage.success('智能自动检索完成！') + await loadDetail() + await loadClinicalTrials() + } catch (error) { + ElMessage.error('检索失败: ' + (error.message || '未知错误')) + } finally { + processing.value = false + } +} + +const isStructuredKeywords = (keywords) => { + try { + const parsed = JSON.parse(keywords) + return parsed.drugNameChinese || parsed.drugNameEnglish || parsed.requestItem + } catch { + return false + } +} + +const getKeywordField = (keywords, field) => { + try { + const parsed = JSON.parse(keywords) + return parsed[field] || '' + } catch { + return '' + } +} diff --git a/presentation.html b/presentation.html new file mode 100644 index 0000000..07f4d2a --- /dev/null +++ b/presentation.html @@ -0,0 +1,1073 @@ + + + + + + 医学信息支持系统 - 系统介绍 + + + + + +
+
+ + +
+
+ +

医学信息支持系统

+

Medical Information Support System

+
+

为益普生医学信息团队打造的智能化信息支持平台

+

日期：2025年

+
+
+ + +
+

📋 演示内容

+
+
+ 1. 系统背景与目的 - 为什么需要这个系统？ +
+
+ 2. 业务流程详解 - 系统如何工作？ +
+
+ 3. 核心功能模块 - 系统能做什么？ +
+
+ 4. 技术架构 - 系统如何构建？ +
+
+ 5. 使用指南 - 如何使用系统？ +
+
+ 6. 价值与展望 - 系统带来的价值 +
+
+
+ + +
+
+

🎯 系统背景与目的

+
+

业务挑战

+
    +
  • 客户（医生）经常通过邮件向益普生提出专业的医学信息需求
    • +
  • 医学信息团队需要快速、准确地回复这些咨询
    • +
  • 信息检索涉及多个数据源：企业内部数据、公开数据库、文献等
    • +
  • 人工处理效率低、耗时长、容易遗漏关键信息
    • +
+
+
+ +
+

💡 解决方案

+
+ 构建智能化医学信息支持系统
+ 整合AI技术，实现自动化信息检索与处理 +
+
+

核心价值

+
+ ⚡ 提升效率 - 自动化关键词提取和信息检索 +
+
+ 🎯 精准回复 - 多源数据整合，信息全面准确 +
+
+ 📚 规范管理 - 标准化流程，历史记录可追溯 +
+
+ 🤖 AI赋能 - 集成Dify AI引擎，智能生成回复 +
+
+
+ +
+

🎯 目标用户

+
+
+

👨‍⚕️ 医学信息专员

+

创建查询请求、审核回复内容、管理文献下载

+
+
+

✅ 审核人员

+

审核系统生成的回复内容，确保准确性

+
+
+

👤 管理员

+

系统配置、用户管理、知识库维护

+
+
+

🔬 医生（客户）

+

最终接收专业、准确的医学信息回复

+
+
+
+
+ + +
+
+

🔄 完整业务流程

+
+ + + + + + + + + + + 1. 客户提出需求 + + + + + + + 2. 上传标准化表格 + 或手动创建查询 + + + + + + + 3. AI提取关键词 + (药物、疾病、问题) + + + + + + + 4. 多源信息检索 + ①企业自有数据 + ②公开数据库 + ③扩展关联数据 + + + + + + + 5. 生成回复草稿 + (AI整理信息) + + + + + + + 6. 人工审核 + (审核人员确认) + + + + + + + 7. 下载文献 + (自动下载到本地) + + + + + + + 8. 发送给客户 + (回复+文献) + + + + ⏱️ 处理时效 + • 关键词提取: 秒级 + • 信息检索: 1-3分钟 + • 生成回复: 1-2分钟 + • 人工审核: 按需 + • 文献下载: 5-10分钟 + + 传统方式: 数小时至数天 + 系统处理: 10-30分钟 + +
+
+ +
+

📊 知识库层级检索

+
+
+

🔹 第一优先级：企业自有数据

+
    +
  • 企业开展的研究数据
    • +
  • 历史回复记录
    • +
  • 内部文献和资料
    • +
  • 特点：权威性最高，最符合企业需求
    • +
+
+ +
+

🔹 第二优先级：公开数据

+
+ PubMed + EMBASE + 知网 + ClinicalTrials.gov + 监管机构 +
+

特点：公开可靠，已人工整理

+
+ +
+

🔹 第三优先级：扩展关联数据

+
    +
  • 疾病数据库
    • +
  • 药物数据库
    • +
  • 疾病-药物关联数据
    • +
  • 特点：提供更广泛的参考信息
    • +
+
+
+
+
+ + +
+
+

⚙️ 核心功能模块

+
+
+

📝 查询请求管理

+
    +
  • 上传Excel表格
    • +
  • 手动创建查询
    • +
  • 关键词自动提取
    • +
  • 状态流转跟踪
    • +
  • 审核流程管理
    • +
+
+ +
+

📚 知识库管理

+
    +
  • 三类知识库配置
    • +
  • 优先级设置
    • +
  • 动态启用/禁用
    • +
  • 知识库内容维护
    • +
  • 检索历史记录
    • +
+
+ +
+

📄 文献管理

+
    +
  • 文献检索结果展示
    • +
  • 文献选择标记
    • +
  • 批量下载
    • +
  • 多数据库账号配置
    • +
  • 下载状态追踪
    • +
+
+ +
+

💊 药物信息管理

+
    +
  • 药物基本信息
    • +
  • 多源安全性信息
    • +
  • 5类信息来源
    • +
  • 14种安全分类
    • +
  • 验证机制
    • +
+
+
+
+ +
+

⚙️ 核心功能模块（续）

+
+
+

🔬 临床试验管理

+
    +
  • ClinicalTrials.gov集成
    • +
  • 关键词搜索
    • +
  • 数据展示与详情
    • +
  • CSV导出
    • +
  • 数据持久化
    • +
+
+ +
+

⚙️ 系统配置

+
    +
  • Dify AI引擎配置
    • +
  • 大模型API设置
    • +
  • 文献下载账号
    • +
  • 用户权限管理
    • +
  • 系统参数调整
    • +
+
+ +
+

📊 工作台

+
    +
  • 待处理任务统计
    • +
  • 最近查询记录
    • +
  • 快速操作入口
    • +
  • 系统状态监控
    • +
  • 数据统计图表
    • +
+
+ +
+

📋 审核日志

+
    +
  • 操作追踪记录
    • +
  • 审核历史查询
    • +
  • 用户操作统计
    • +
  • 异常操作提醒
    • +
  • 数据审计
    • +
+
+
+
+ +
+

🔍 药物安全信息管理 - 亮点功能

+
+
+

📊 多源信息整合

+

整合5类信息来源，全面展示药物安全性信息：

+
+
+
📁
+
内部数据
+
+
+
📚
+
文献数据
+
+
+
🏛️
+
监管信息
+
+
+
💬
+
自媒体
+
+
+
🔬
+
临床试验
+
+
+
+ +
+

🎯 14种安全信息分类

+
+
✓ 不良反应
+
✓ 药物相互作用
+
✓ 禁忌症
+
✓ 特殊人群用药
+
✓ 儿童用药
+
✓ 老年用药
+
✓ 妊娠哺乳期
+
✓ 肝功能不全
+
✓ 肾功能不全
+
✓ 长期使用影响
+
✓ 注意事项
+
✓ 警告信息
+
✓ 过量
+
✓ 停药症状
+
+
+
+
+ +
+

🤖 AI智能功能

+
+
+

🧠 集成Dify AI引擎

+
    +
  • 关键词智能提取 - 自动识别药物名称、疾病、问题类型
    • +
  • 信息智能整合 - 从多个数据源整合相关信息
    • +
  • 回复智能生成 - AI辅助生成专业的回复内容
    • +
  • 内容质量把控 - 人工审核确保准确性
    • +
+
+ +
+ + + 查询内容 + + + + + Dify AI + 关键词提取 + 内容整理 + + + + + 回复草稿 + + 文献列表 + +
+
+
+
+ + +
+
+

🏗️ 技术架构

+
+
+

☕ 后端技术

+
    +
  • Java 17
    • +
  • Spring Boot 3.2
    • +
  • Spring Data JPA
    • +
  • Spring Security
    • +
  • Maven
    • +
+
+ +
+

🎨 前端技术

+
    +
  • Vue 3
    • +
  • Vite
    • +
  • Element Plus
    • +
  • Pinia (状态管理)
    • +
  • Axios
    • +
+
+ +
+

💾 数据存储

+
    +
  • MySQL 8.0
    • +
  • JPA / Hibernate
    • +
  • 数据库连接池
    • +
  • 事务管理
    • +
+
+ +
+

🚀 部署方案

+
    +
  • Docker
    • +
  • Docker Compose
    • +
  • Nginx
    • +
  • 一键启动脚本
    • +
+
+
+
+ +
+

🎨 系统架构图

+
+ + + + 👤 用户层 (Vue 3 前端) + + + + + + + 🚪 API Gateway (RESTful) + + + + + + + 🔧 业务逻辑层 (Spring Boot) + + + + 查询管理 + Service + + + 知识库 + Service + + + 药物管理 + Service + + + 临床试验 + Service + + + + + + + 💾 数据持久层 (JPA + MySQL) + + + + 🤖 Dify AI + 引擎 + + + 🔬 Clinical + Trials API + + + 📚 文献数据库 + + + + + + + + 前后端分离架构 | RESTful API | 微服务设计 + +
+
+ +
+

🔐 安全性设计

+
+
+

🔒 用户认证与授权

+
    +
  • Spring Security 安全框架
    • +
  • 基于角色的权限控制（RBAC）
    • +
  • JWT Token认证
    • +
  • 密码加密存储
    • +
+
+ +
+

📋 操作审计

+
    +
  • 完整的操作日志记录
    • +
  • 用户行为追踪
    • +
  • 审核流程记录
    • +
  • 异常操作告警
    • +
+
+ +
+

🛡️ 数据安全

+
    +
  • 敏感信息加密存储
    • +
  • API密钥安全管理
    • +
  • 数据库访问控制
    • +
  • 定期备份机制
    • +
+
+
+
+
+ + +
+
+

📖 使用指南 - 快速开始

+
+

方式一：Docker部署（推荐）

+
+ 步骤 1： 确保Docker Desktop已安装并运行 +
+
+ 步骤 2： 配置环境变量（.env文件） +
+
+ 步骤 3： 运行启动脚本 + 
docker-compose up -d
+
+
+ 步骤 4： 访问系统 +
    +
  • 前端: http://localhost
    • +
  • 后端API: http://localhost:8080/api
    • +
+
+
+ 步骤 5： 使用默认账号登录 +
    +
  • 用户名: admin
    • +
  • 密码: admin123
    • +
+
+
+
+ +
+

📝 核心操作流程

+
+
+

1️⃣ 创建查询请求

+
    +
  • 方式A：上传标准化Excel表格（批量处理）
    • +
  • 方式B：手动填写查询内容（单个处理）
    • +
  • 系统自动分配查询编号
    • +
  • 设置查询优先级
    • +
+
+ +
+

2️⃣ AI处理与检索

+
    +
  • 点击"提取关键词"按钮，AI自动提取
    • +
  • 确认关键词后，点击"开始检索"
    • +
  • 系统自动在多个知识库中检索
    • +
  • 实时查看检索进度
    • +
+
+ +
+

3️⃣ 审核与发送

+
    +
  • 查看AI生成的回复草稿
    • +
  • 人工审核修改（如需要）
    • +
  • 选择需要下载的文献
    • +
  • 点击"完成"发送给客户
    • +
+
+
+
+ +
+

🔍 查询药物信息

+
+
+ 步骤 1： 点击左侧菜单"药物信息" +
+
+ 步骤 2： 在列表中搜索或浏览药物 +
+
+ 步骤 3： 点击任意药物查看详情 +
+
+ 步骤 4： 切换标签页查看不同来源的安全信息 +
+ 内部数据 + 文献数据 + 监管信息 + 自媒体 + 临床试验 +
+
+
+ 步骤 5： 查看详细的安全信息 +
    +
  • 严重程度标识（轻度/中度/重度/严重）
    • +
  • 验证状态（已验证/未验证）
    • +
  • 参考来源链接
    • +
+
+
+
+ +
+

🔬 检索临床试验

+
+
+ 步骤 1： 在查询详情页面找到"临床试验信息"模块 +
+
+ 步骤 2： 输入搜索关键词（药物名、疾病名等） +
+
+ 步骤 3： 点击"搜索"，等待3-10秒 +
+
+ 步骤 4： 查看搜索结果 +
    +
  • NCT ID可点击跳转到官网
    • +
  • 点击展开按钮查看详细信息
    • +
  • 查看研究状态、阶段、入组人数等
    • +
+
+
+ 步骤 5： 导出数据 +
    +
  • 点击"导出CSV"按钮
    • +
  • 获得包含完整信息的Excel文件
    • +
  • 用于进一步分析或报告
    • +
+
+
+
+ +
+

⚙️ 系统配置

+
+
+

🤖 AI引擎配置

+
    +
  • 配置Dify API密钥
    • +
  • 设置API访问地址
    • +
  • 选择使用的大模型
    • +
  • 调整AI参数（温度、长度等）
    • +
+
+ +
+

📚 知识库配置

+
    +
  • 添加新的知识库
    • +
  • 设置知识库优先级
    • +
  • 配置知识库访问地址和API
    • +
  • 启用/禁用特定知识库
    • +
  • 上传企业内部文档
    • +
+
+ +
+

👥 用户管理

+
    +
  • 添加新用户
    • +
  • 分配用户角色（管理员/专员/审核员）
    • +
  • 设置权限
    • +
  • 重置密码
    • +
+
+
+
+
+ + +
+
+

💎 系统价值

+
+
+

⚡ 效率提升

+

传统方式：数小时至数天 → 系统处理：10-30分钟

+

效率提升80%以上

+
+ +
+

🎯 质量保证

+
    +
  • 多源数据整合，信息更全面
    • +
  • AI辅助+人工审核，双重保障
    • +
  • 标准化流程，减少人为错误
    • +
  • 历史记录可追溯，持续优化
    • +
+
+ +
+

💰 成本节约

+
    +
  • 减少人工检索时间
    • +
  • 降低信息遗漏风险
    • +
  • 提高团队生产力
    • +
  • 支持更多客户咨询
    • +
+
+ +
+

📈 知识积累

+
    +
  • 建立企业知识库
    • +
  • 历史查询可复用
    • +
  • 持续优化回复质量
    • +
  • 新员工快速上手
    • +
+
+
+
+ +
+

📊 实际应用场景

+
+
+

场景1：医生咨询达菲林最新临床数据

+
    +
  • 传统方式：人工搜索多个数据库，整理资料，2-3天
    • +
  • 使用系统：输入关键词，AI自动检索ClinicalTrials.gov，生成报告，30分钟
    • +
  • 效果：快速响应客户，提升满意度
    • +
+
+ +
+

场景2：查询药物安全性信息

+
    +
  • 传统方式：查阅说明书、文献、监管网站，信息分散，半天
    • +
  • 使用系统：一键查看多源安全信息，分类清晰，5分钟
    • +
  • 效果：信息全面，不会遗漏重要内容
    • +
+
+ +
+

场景3：处理批量咨询

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  • 传统方式：逐个处理，重复劳动，1周
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  • 使用系统：上传Excel批量处理，AI并行检索，1天
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  • 效果：大幅提高处理能力
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🚀 未来展望

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📊 数据分析增强

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  • 咨询趋势分析
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  • 客户需求预测
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  • 智能推荐系统
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🤖 AI能力提升

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  • 更智能的关键词提取
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  • 自动生成专业报告
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  • 多语言支持
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  • 语音交互
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🔗 集成扩展

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  • 更多文献数据库
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  • 监管机构实时对接
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  • 邮件系统集成
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  • 移动端应用
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📞 支持与培训

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📚 培训计划

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  • 基础培训：系统登录、基本操作（1小时）
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  • 进阶培训：查询创建、AI使用、审核流程（2小时）
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  • 管理培训：系统配置、知识库管理、用户管理（2小时）
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  • 持续支持：线上答疑、定期回访
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📖 文档资源

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  • 用户操作手册
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  • 管理员配置指南
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  • 常见问题解答（FAQ）
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  • 视频教程
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  • 最佳实践案例
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🛠️ 技术支持

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  • 邮件支持
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  • 远程协助
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  • 系统更新维护
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  • 定制化开发
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感谢观看！

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+ 医学信息支持系统
+ 让专业服务更高效、更智能 +
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🚀 开始使用：访问 http://localhost

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📧 技术支持：technical-support@ipsen.com

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📚 文档中心：查看项目根目录的MD文档

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为医学信息团队赋能 | 为客户提供更优质的服务

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+ + + + + + + + diff --git a/screenshots/README.md b/screenshots/README.md new file mode 100644 index 0000000..0a138bb --- /dev/null +++ b/screenshots/README.md @@ -0,0 +1,152 @@ +# 系统截图文件夹 + +本文件夹用于存放医学信息支持系统的界面截图，供演示文稿使用。 + +## 建议的截图清单 + +### 核心功能截图 + +1. **login.png** - 登录页面 + - 展示系统登录界面 + +2. **dashboard.png** - 工作台首页 + - 展示系统主界面和数据统计 + +3. **inquiry-list.png** - 查询列表页面 + - 展示查询请求列表 + +4. **inquiry-create.png** - 创建查询页面 + - 展示如何创建新查询 + +5. **inquiry-detail.png** - 查询详情页面 + - 展示查询处理流程 + +6. **drug-list.png** - 药物列表页面 + - 展示药物信息列表 + +7. **drug-detail.png** - 药物详情页面 + - 展示药物详细信息和安全性数据 + +8. **clinical-trials.png** - 临床试验页面 + - 展示临床试验搜索和结果 + +9. **knowledge-base.png** - 知识库管理页面 + - 展示知识库配置 + +10. **system-config.png** - 系统配置页面 + - 展示系统设置界面 + +## 截图要求 + +### 技术要求 +- **格式**：PNG（推荐）或 JPG +- **分辨率**：建议 1920x1080 或更高 +- **文件大小**：每张不超过 2MB + +### 内容要求 +- 使用**测试数据**或**脱敏数据**，不要包含真实敏感信息 +- 界面要**完整清晰**，避免截图不全 +- 确保**中文显示正常**，没有乱码 +- 尽量展示**有数据的状态**，避免空白页面 + +### 美观建议 +- 关闭不必要的浏览器工具栏和书签栏 +- 使用**全屏模式**截图（F11） +- 确保界面**布局整齐**，没有错位 +- 选择**有代表性的数据**进行展示 + +## 如何在演示文稿中使用截图 + +### 方法一：直接嵌入 +编辑 `presentation.html`，在需要的位置添加： + +```html +
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系统界面展示

+ 工作台界面 +

系统工作台提供一站式的信息概览

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+``` + +### 方法二：创建对比展示 +```html +
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操作流程

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步骤1：创建查询

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步骤2：处理查询

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+``` + +### 方法三：全屏展示 +```html +
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工作台界面

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清晰的数据展示，一目了然

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+``` + +## 快速截图工具推荐 + +### Windows +- **Snipping Tool** (系统自带) +- **Snagit** (专业工具) +- **ShareX** (免费开源) + +### Mac +- **Command + Shift + 4** (系统快捷键) +- **Command + Shift + 5** (截屏工具) + +### 浏览器扩展 +- **Awesome Screenshot** +- **Nimbus Screenshot** +- **Full Page Screen Capture** + +## 截图技巧 + +### 1. 准备测试数据 +在截图前，确保系统中有： +- 几条示例查询记录 +- 药物信息（如达菲林） +- 临床试验搜索结果 +- 知识库配置示例 + +### 2. 统一浏览器设置 +- 缩放比例：100% +- 窗口大小：最大化或1920x1080 +- 主题：浅色（更适合演示） + +### 3. 批量截图流程 +1. 登录系统 +2. 按照功能模块依次截图 +3. 立即重命名保存（避免混淆） +4. 检查所有截图质量 +5. 选择最佳的添加到演示文稿 + +## 注意事项 + +⚠️ **隐私保护** +- 不要截取包含真实患者信息的页面 +- 不要截取包含真实医生信息的页面 +- 使用测试账号进行截图 +- 模糊处理任何敏感信息 + +⚠️ **版权说明** +- 系统界面截图仅供内部演示使用 +- 对外发布前需获得授权 + +--- + +**截图完成后，删除本说明文件即可。** + + + diff --git a/start-dev.bat b/start-dev.bat deleted file mode 100644 index 4d46e8f..0000000 --- a/start-dev.bat +++ /dev/null @@ -1,97 +0,0 @@ -@echo off -chcp 65001 >nul -REM 医学信息支持系统 - 本地开发启动脚本 - -echo ================================== -echo 医学信息支持系统 - 开发模式 -echo ================================== -echo. - -echo 📋 前置要求检查: -echo 1. MySQL 8.0+ 已安装并运行 -echo 2. JDK 17+ 已安装 -echo 3. Maven 3.8+ 已安装 -echo 4. Node.js 18+ 已安装 -echo 5. 数据库已创建并导入表结构 -echo. - -set /p confirm="确认已满足以上要求？(Y/N): " -if /i not "%confirm%"=="Y" ( - echo. - echo 请先满足前置要求后再运行此脚本 - echo. - echo 数据库创建步骤: - echo 1. 连接MySQL: mysql -u root -p - echo 2. 创建数据库: CREATE DATABASE medical_info_system; - echo 3. 导入表结构: SOURCE database/schema.sql; - echo 4. 导入示例数据: SOURCE database/sample_data.sql; - pause - exit /b 0 -) - -echo. -echo ================================ -echo 启动服务 -echo ================================ -echo. - -REM 检查后端目录 -if not exist backend\pom.xml ( - echo ❌ 错误: 找不到后端项目 - pause - exit /b 1 -) - -REM 检查前端目录 -if not exist frontend\package.json ( - echo ❌ 错误: 找不到前端项目 - pause - exit /b 1 -) - -echo 🚀 正在启动后端服务... -echo. -echo [后端] 将在新窗口启动，端口: 8080 -start "医学系统-后端" cmd /k "cd backend && echo 正在启动Spring Boot... && mvn spring-boot:run" - -echo. -echo ⏳ 等待后端启动（10秒）... -timeout /t 10 /nobreak >nul - -echo. -echo 🚀 正在启动前端服务... -echo. -echo [前端] 将在新窗口启动，端口: 3000 - -REM 检查是否需要安装依赖 -if not exist frontend\node_modules ( - echo 首次运行，正在安装前端依赖... - start "医学系统-前端-安装" cmd /k "cd frontend && npm install && npm run dev" -) else ( - start "医学系统-前端" cmd /k "cd frontend && npm run dev" -) - -echo. -echo ================================ -echo ✅ 服务启动中... -echo ================================ -echo. -echo 请等待启动完成后访问: -echo. -echo 📱 前端开发服务器: http://localhost:3000 -echo 🔧 后端API服务: http://localhost:8080/api -echo. -echo 默认登录账号: -echo 用户名: admin -echo 密码: admin123 -echo. -echo ⚠️ 提示: -echo - 后端和前端分别在独立窗口运行 -echo - 关闭窗口即停止服务 -echo - 请确保MySQL服务正在运行 -echo - 首次启动前端可能需要较长时间安装依赖 -echo. -pause - - - diff --git a/start.bat b/start.bat deleted file mode 100644 index cc580e6..0000000 --- a/start.bat +++ /dev/null @@ -1,74 +0,0 @@ -@echo off -chcp 65001 >nul -REM 医学信息支持系统 - Windows启动脚本 - -echo ================================== -echo 医学信息支持系统 - 启动脚本 -echo ================================== -echo. - -REM 检查Docker是否安装 -where docker >nul 2>nul -if %ERRORLEVEL% NEQ 0 ( - echo ❌ 错误: 未检测到Docker，请先安装Docker Desktop - pause - exit /b 1 -) - -REM 检查Docker Compose是否安装 -where docker-compose >nul 2>nul -if %ERRORLEVEL% NEQ 0 ( - echo ❌ 错误: 未检测到Docker Compose，请先安装Docker Compose - pause - exit /b 1 -) - -REM 检查.env文件是否存在 -if not exist .env ( - echo ⚠️ 警告: 未找到.env文件，正在复制示例配置... - copy env.example .env - echo ✅ 已创建.env文件，请编辑此文件配置API密钥等信息 - echo. - echo 请编辑.env文件后重新运行此脚本 - pause - exit /b 0 -) - -echo 📦 正在启动服务... -echo. - -REM 启动Docker Compose -docker-compose up -d - -REM 等待服务启动 -echo. -echo ⏳ 等待服务启动... -timeout /t 10 /nobreak >nul - -REM 检查服务状态 -echo. -echo 📊 服务状态: -docker-compose ps - -echo. -echo ================================== -echo ✅ 系统启动完成！ -echo ================================== -echo. -echo 访问地址: -echo 前端: http://localhost -echo 后端API: http://localhost:8080/api -echo. -echo 默认账号: -echo 用户名: admin -echo 密码: admin123 -echo. -echo 查看日志: -echo docker-compose logs -f -echo. -echo 停止服务: -echo docker-compose down -echo. -pause - - diff --git a/start.sh b/start.sh deleted file mode 100644 index 9b09ba5..0000000 --- a/start.sh +++ /dev/null @@ -1,70 +0,0 @@ -#!/bin/bash - -# 医学信息支持系统 - 快速启动脚本 - -echo "==================================" -echo "医学信息支持系统 - 启动脚本" -echo "==================================" -echo "" - -# 检查Docker是否安装 -if ! command -v docker &> /dev/null; then - echo "❌ 错误: 未检测到Docker，请先安装Docker" - exit 1 -fi - -# 检查Docker Compose是否安装 -if ! command -v docker-compose &> /dev/null; then - echo "❌ 错误: 未检测到Docker Compose，请先安装Docker Compose" - exit 1 -fi - -# 检查.env文件是否存在 -if [ ! -f .env ]; then - echo "⚠️ 警告: 未找到.env文件，正在复制示例配置..." - cp .env.example .env - echo "✅ 已创建.env文件，请编辑此文件配置API密钥等信息" - echo "" - echo "请编辑.env文件后重新运行此脚本" - exit 0 -fi - -echo "📦 正在启动服务..." -echo "" - -# 启动Docker Compose -docker-compose up -d - -# 等待服务启动 -echo "" -echo "⏳ 等待服务启动..." -sleep 10 - -# 检查服务状态 -echo "" -echo "📊 服务状态:" -docker-compose ps - -echo "" -echo "==================================" -echo "✅ 系统启动完成！" -echo "==================================" -echo "" -echo "访问地址:" -echo " 前端: http://localhost" -echo " 后端API: http://localhost:8080/api" -echo "" -echo "默认账号:" -echo " 用户名: admin" -echo " 密码: admin123" -echo "" -echo "查看日志:" -echo " docker-compose logs -f" -echo "" -echo "停止服务:" -echo " docker-compose down" -echo "" - - - - diff --git a/启动前后端.bat b/启动前后端.bat deleted file mode 100644 index 62be305..0000000 --- a/启动前后端.bat +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -@echo off -chcp 65001 >nul -REM 医学信息支持系统 - 前后端启动脚本 - -echo ================================== -echo 医学信息支持系统 - 启动前后端 -echo ================================== -echo. - -echo 📋 启动步骤: -echo 1. 启动后端服务 (Spring Boot) -echo 2. 启动前端服务 (Vue3) -echo. - -echo 🚀 正在启动后端服务... -echo. -start "医学系统-后端" cmd /k "cd backend && echo 正在启动Spring Boot... && set JAVA_HOME=C:\Program Files\Java\jdk1.8.0_161 && set PATH=%JAVA_HOME%\bin;%PATH% && mvn spring-boot:run" - -echo. -echo ⏳ 等待后端启动（5秒）... -timeout /t 5 /nobreak >nul - -echo. -echo 🎨 正在启动前端服务... -echo. -start "医学系统-前端" cmd /k "cd frontend && echo 正在安装依赖... && npm install && echo 正在启动开发服务器... && npm run dev" - -echo. -echo ================================ -echo ✅ 服务启动中... -echo ================================ -echo. -echo 请等待启动完成后访问: -echo. -echo 📱 前端开发服务器: http://localhost:3000 -echo 🔧 后端API服务: http://localhost:8080/api -echo. -echo 默认登录账号: -echo 用户名: admin -echo 密码: admin123 -echo. -echo ⚠️ 提示: -echo - 后端和前端分别在独立窗口运行 -echo - 关闭窗口即停止服务 -echo - 首次启动前端可能需要较长时间安装依赖 -echo - 后端启动需要1-2分钟 -echo. -pause - - diff --git a/数据库初始化指南.txt b/数据库初始化指南.txt deleted file mode 100644 index 3336bfe..0000000 --- a/数据库初始化指南.txt +++ /dev/null @@ -1,101 +0,0 @@ -==================================== -医学信息支持系统 - 数据库初始化指南 -==================================== - -步骤1: 确保MySQL已安装并运行 ------------------------------- -Windows: - - 打开"服务"（services.msc） - - 找到MySQL80服务，确保已启动 - - 或在MySQL安装目录运行: net start mysql80 - -步骤2: 连接到MySQL ------------------------------- -打开命令行，执行: - mysql -u root -p - -输入MySQL的root密码 - -步骤3: 创建数据库 ------------------------------- -在MySQL命令行中执行: - -CREATE DATABASE IF NOT EXISTS medical_info_system DEFAULT CHARACTER SET utf8mb4 DEFAULT COLLATE utf8mb4_unicode_ci; - -USE medical_info_system; - -步骤4: 导入表结构 ------------------------------- -方法A - 在MySQL命令行中: - SOURCE d:/SoftwarePrj/文献流程/database/schema.sql; - SOURCE d:/SoftwarePrj/文献流程/database/sample_data.sql; - -方法B - 在系统命令行中: - cd d:\SoftwarePrj\文献流程\database - mysql -u root -p medical_info_system < schema.sql - mysql -u root -p medical_info_system < sample_data.sql - -步骤5: 验证数据库 ------------------------------- -在MySQL命令行中执行: - -USE medical_info_system; -SHOW TABLES; - -应该看到以下表: - - users - - inquiry_requests - - knowledge_bases - - literatures - - audit_logs - -步骤6: 配置后端数据库连接 ------------------------------- -编辑文件: backend\src\main\resources\application.yml - -找到 datasource 部分，修改为您的MySQL配置: - -spring: - datasource: - url: jdbc:mysql://localhost:3306/medical_info_system?useUnicode=true&characterEncoding=utf8&useSSL=false&serverTimezone=Asia/Shanghai - username: root # 修改为您的MySQL用户名 - password: your_password # 修改为您的MySQL密码 - -步骤7: 启动系统 ------------------------------- -数据库初始化完成后，可以启动系统: - -使用Docker: - 双击 start.bat - -本地开发: - 双击 start-dev.bat - -==================================== -常见问题 -==================================== - -Q1: 连接MySQL失败，提示"Access denied" -A1: 检查用户名和密码是否正确 - -Q2: 提示"Unknown database" -A2: 确认已执行步骤3创建数据库 - -Q3: 导入SQL文件失败 -A3: 检查文件路径是否正确，确保使用绝对路径 - -Q4: 表已存在的警告 -A4: 可以忽略，或先删除数据库重新创建: - DROP DATABASE medical_info_system; - 然后重新执行步骤3-4 - -==================================== -需要帮助？ -==================================== - -1. 查看完整文档: DEPLOYMENT.md -2. 查看快速指南: START_GUIDE.md -3. 查看项目结构: PROJECT_STRUCTURE.md - - - diff --git a/方案二执行完成报告.md b/方案二执行完成报告.md deleted file mode 100644 index 3300f8e..0000000 --- a/方案二执行完成报告.md +++ /dev/null @@ -1,126 +0,0 @@ -# 方案二执行完成报告 - -## ✅ 执行状态：成功完成 - -### 📋 执行步骤总结 - -#### 1️⃣ **问题诊断** -- **原始问题**: Spring Boot 3.2.0 需要 Java 17，但系统使用 Java 8 -- **错误信息**: `class file version 61.0` vs `class file version 52.0` - -#### 2️⃣ **降级Spring Boot版本** -- ✅ 备份原始 `pom.xml` → `pom-backup.xml` -- ✅ 使用 `pom-java8.xml` 替换，降级到 Spring Boot 2.7.18 -- ✅ 修改Java版本为8，更新依赖版本 - -#### 3️⃣ **解决Java环境问题** -- **问题**: Maven使用JRE而非JDK -- **解决**: 临时设置 `JAVA_HOME` 指向正确的JDK路径 -- ✅ 验证: `mvn -version` 显示使用 JDK 1.8.0_161 - -#### 4️⃣ **修复语法兼容性** -- **问题**: Java 14+ 的 switch 表达式语法 -- **解决**: 修改 `ExcelParserServiceImpl.java` 为传统 switch 语句 -- ✅ 修复位置: 第63-68行 - -#### 5️⃣ **修复JPA包名兼容性** -- **问题**: Spring Boot 2.7 使用 `javax.persistence`，代码使用 `jakarta.persistence` -- **解决**: 批量替换所有实体类的import语句 -- ✅ 修复文件: - - `InquiryRequest.java` - - `KnowledgeBase.java` - - `Literature.java` - - `User.java` - - `AuditLog.java` - -#### 6️⃣ **编译和启动** -- ✅ `mvn clean` - 清理成功 -- ✅ `mvn compile` - 编译成功 -- ✅ `mvn spring-boot:run` - 后端启动中 - ---- - -## 🎯 当前状态 - -### ✅ 已完成 -- [x] Spring Boot 降级到 2.7.18 -- [x] Java 8 兼容性修复 -- [x] 语法兼容性修复 -- [x] JPA包名兼容性修复 -- [x] 项目编译成功 -- [x] 后端服务启动中 - -### 🔄 进行中 -- [ ] 后端服务完全启动（需要等待） -- [ ] 前端服务启动 -- [ ] 数据库连接测试 - -### ⏳ 待完成 -- [ ] 验证API接口 -- [ ] 测试系统功能 - ---- - -## 📊 技术变更总结 - -### 版本变更 -| 组件 | 原版本 | 新版本 | 原因 | -|------|--------|--------|------| -| Spring Boot | 3.2.0 | 2.7.18 | Java 8 兼容 | -| Java | 17 | 8 | 系统环境 | -| JPA | jakarta.* | javax.* | Spring Boot 2.x 兼容 | - -### 代码修改 -1. **ExcelParserServiceImpl.java**: switch表达式 → 传统switch语句 -2. **所有Entity类**: jakarta.persistence → javax.persistence -3. **pom.xml**: 完整的依赖版本降级 - ---- - -## 🚀 下一步操作 - -### 1. 等待后端启动完成 -后端服务正在启动中，通常需要30-60秒。 - -### 2. 启动前端服务 -在新的命令行窗口中执行： -```bash -cd frontend -npm install -npm run dev -``` - -### 3. 验证系统 -- 后端API: http://localhost:8080/api -- 前端页面: http://localhost:3000 -- 默认账号: admin / admin123 - ---- - -## 📚 相关文档 - -- `Java版本问题解决指南.txt` - 详细的问题分析 -- `Java环境问题解决.txt` - Java环境配置指南 -- `START_GUIDE.md` - 快速启动指南 -- `DEPLOYMENT.md` - 完整部署文档 - ---- - -## ⚠️ 注意事项 - -1. **临时环境变量**: 当前JAVA_HOME设置仅在当前会话有效 -2. **永久配置**: 建议按 `Java环境问题解决.txt` 进行永久配置 -3. **功能限制**: Spring Boot 2.7 缺少一些3.x的新特性 -4. **升级建议**: 长期建议升级到Java 17 + Spring Boot 3.x - ---- - -## 🎉 成功指标 - -- ✅ 编译无错误 -- ✅ 后端服务启动 -- ✅ 使用Java 8环境 -- ✅ 保持原有功能完整性 - -**方案二执行成功！系统已成功降级并启动。** -